207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3516 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  77.78 
 
 		 411 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 379 aa  783    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  78.84 
 
 		 379 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  80 
 
 		 382 aa  648    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  76.19 
 
 		 379 aa  624  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  75.13 
 
 		 383 aa  620  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  42.15 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  28.3 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  28.41 
 
 		 337 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  27.81 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.43 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.72 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  30.2 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.93 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.57 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  28.87 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  25.56 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.72 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  28.79 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  27.37 
 
 		 333 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 		 328 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  27.46 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.9 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.08 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  24.53 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  26.92 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  27.72 
 
 		 333 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25.49 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  26.6 
 
 		 325 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  25.21 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.83 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.7 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  24.9 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  26.57 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  24.81 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.34 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  27.63 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  25.64 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  26.49 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.28 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.28 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  25.14 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  24.31 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  23.99 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  22.17 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.3 
 
 		 313 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  25.39 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  25.36 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.09 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.85 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  27.82 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  23.4 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.61 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  23.95 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  26.42 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.38 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  22.65 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  24.59 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  28.68 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.75 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.72 
 
 		 332 aa  67  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  25.43 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  24.27 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  26.22 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.02 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  26.16 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  24.04 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  21.98 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  23 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  24.73 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.68 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  24.91 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  24.26 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.07 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>