More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1802 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4086  regulatory protein IclR  79.1 
 
 		 291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  84.52 
 
 		 262 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 263 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  71.48 
 
 		 262 aa  362  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  65.22 
 
 		 265 aa  344  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  35.32 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  33.76 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  29.82 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  33.19 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  32.52 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  31.72 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  30.08 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  28.95 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  28.63 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  26.36 
 
 		 263 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  26.92 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 275 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 271 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.16 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  34.64 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  30.22 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  25.86 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 554 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 549 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2258  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0920  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687031  normal  0.0182204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0337  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1109  IclR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3645  IclR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3950  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000408149  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.94 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3648  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  24.56 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>