More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3258 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 600 aa  1211    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  58.1 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  48.06 
 
 		 563 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  48.06 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  43.97 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 570 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  43.33 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  43.64 
 
 		 563 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  43.57 
 
 		 550 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  42.94 
 
 		 593 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  40.07 
 
 		 572 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  40.71 
 
 		 524 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  48.33 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 549 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  35.4 
 
 		 545 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 545 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 556 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 559 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 546 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  39.88 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 538 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.14 
 
 		 545 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 545 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 		 557 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 581 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  46.45 
 
 		 230 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 545 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 395 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  28.5 
 
 		 358 aa  100  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 345 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.73 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 874 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 322 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 636 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.02 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  23.19 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 298 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 275 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 		 273 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 287 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.27 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 295 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  24.66 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  26.9 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.17 
 
 		 1144 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.23 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  29.06 
 
 		 867 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.9 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  26.09 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1115 aa  77.8  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1103 aa  78.2  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  26.97 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.37 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 267 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 795 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1107 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  29.07 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  28.16 
 
 		 1110 aa  75.5  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  23.67 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  24.61 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.59 
 
 		 773 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 840 aa  73.9  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 807 aa  74.3  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  25.98 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  27.54 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  24.16 
 
 		 270 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 868 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 853 aa  73.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  25 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>