More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0325 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  71.19 
 
 		 436 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  880    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  72.13 
 
 		 453 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  70.14 
 
 		 427 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  69.27 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  70.87 
 
 		 414 aa  591  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  54.27 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  45.5 
 
 		 432 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  49.39 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  44.39 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  29.1 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  27.59 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  29.63 
 
 		 439 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  28.31 
 
 		 448 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.89 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  28.91 
 
 		 448 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  28.08 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  27.57 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  27.82 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  31.07 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  31 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  29.53 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  29.06 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  29.5 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  26.28 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  26.28 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  26.28 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  25.74 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  25.23 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  28.92 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  26.13 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  26.18 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  24.92 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.23 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.91 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  25.82 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.24 
 
 		 624 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.51 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  24.12 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  23.83 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.28 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  22.83 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  27.68 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.25 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.79 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.65 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  20.35 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  24.46 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.88 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  22.03 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.52 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25.62 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  21.63 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  69.23 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.89 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.12 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  69.23 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  21.41 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  25 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2823  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  69.23 
 
 		 502 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  25.78 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2319  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  48.08 
 
 		 578 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000648814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3592  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.67 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4693  normal  0.0250321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0696  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.96 
 
 		 577 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5692  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.1 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1954  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  48.08 
 
 		 579 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.151886  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  25.78 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0031  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.96 
 
 		 578 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.43195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  65.79 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  21.79 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0130  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  46.15 
 
 		 578 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.67 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  66.67 
 
 		 485 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  66.67 
 
 		 485 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.67 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.67 
 
 		 488 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 487 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2960  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.1 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  64.1 
 
 		 487 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  61.54 
 
 		 487 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3043  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.54 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  64.1 
 
 		 488 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3102  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.54 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3059  glutamate synthase (NADH) small subunit  61.54 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.519079  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0038  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  48.08 
 
 		 578 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.093726  normal  0.0842207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  56.41 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  58.97 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  64.1 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  24.79 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>