140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1606 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1606  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 311 aa  610  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.945482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3095  ribonuclease BN, putative  84.95 
 
 		 302 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1313  ribonuclease BN  67.12 
 
 		 300 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0115904  normal  0.255561 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3591  ribonuclease BN  66.09 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.595872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  66.78 
 
 		 313 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5294  ribonuclease BN  68.14 
 
 		 300 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2419  ribonuclease BN, putative  73.97 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662765  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3981  ribonuclease BN, putative  59.66 
 
 		 301 aa  332  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0234  ribonuclease BN  61.15 
 
 		 296 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2719  ribonuclease BN  51.2 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0535  putative ribonuclease BN  46.8 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2400  hypothetical protein  47.62 
 
 		 80 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  26.87 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.16 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  26.33 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  23.83 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  25.26 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  21.2 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  25.95 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0704  putative ribonuclease BN  26.26 
 
 		 451 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.71296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.48 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  22.61 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  23.88 
 
 		 405 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  25.57 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0548  tRNA-processing RNAse BN  23.85 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  24.91 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0536  ribonuclease BN, putative  24.23 
 
 		 525 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.031655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  24.41 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  24.61 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  22.7 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0693  ribonuclease BN  22.09 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  26.19 
 
 		 437 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.47 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1337  putative ribonuclease BN  27.31 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.45 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1793  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  24 
 
 		 443 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.34 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  27.31 
 
 		 442 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  20.64 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  27.31 
 
 		 442 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0406  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 436 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0756  tRNA-processing ribonuclease BN  26.59 
 
 		 436 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 442 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0711  ribonuclease BN, putative  31.3 
 
 		 422 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0788126  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  24.81 
 
 		 411 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.29 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  23.11 
 
 		 405 aa  49.7  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.1 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 443 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  23.44 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1636  ribonuclease BN  36.96 
 
 		 447 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.74 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2779  ribonuclease BN  22.96 
 
 		 453 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00809939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  32 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  24.44 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2460  ribonuclease BN, putative  22.55 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.81 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  22.52 
 
 		 538 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4878  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000922798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.17 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  33.72 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  23.64 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2618  YihY family protein  25.4 
 
 		 437 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  22.57 
 
 		 384 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  33.72 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  33.72 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0521  putative ribonuclease BN  26.54 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  21.43 
 
 		 446 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4401  ribonuclease BN  21.68 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3482  ribonuclease BN  24.12 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  21.98 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  31.4 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0979  putative ribonuclease BN  23.31 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  21.11 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 436 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  21.11 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  21.11 
 
 		 323 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4351  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4305  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.269266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4260  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4416  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  23.6 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>