More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1450 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1450  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  945    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.107409  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1269  ribonuclease  41.68 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.373877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1186  ribonuclease  41.27 
 
 		 454 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  40.59 
 
 		 465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  35.99 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0135  ribonuclease  38.49 
 
 		 463 aa  269  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.7 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.49 
 
 		 571 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  35.25 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  32.81 
 
 		 490 aa  256  7e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  31.5 
 
 		 487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  30.18 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  31.17 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  37.56 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  31.6 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  30.94 
 
 		 489 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  30.92 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  30.72 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  31.84 
 
 		 494 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  30.46 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  30.46 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  34.41 
 
 		 515 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  31.96 
 
 		 411 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  35.83 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  34.7 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  29.16 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  37.34 
 
 		 474 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  31.29 
 
 		 483 aa  239  6.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  30.87 
 
 		 488 aa  239  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  34.52 
 
 		 1427 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  33.12 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  30.75 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  30.75 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1564  RNAse E  33.92 
 
 		 873 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.270508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  33.03 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  29.57 
 
 		 492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  33.41 
 
 		 908 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  34.79 
 
 		 1007 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  34.8 
 
 		 1041 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1040 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  33.41 
 
 		 792 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  33.82 
 
 		 942 aa  233  6e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  35.68 
 
 		 416 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.54 
 
 		 990 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  31.38 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  34.62 
 
 		 1093 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  31.31 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  32 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  30.18 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  33.41 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  32.75 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  31.71 
 
 		 502 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  34.22 
 
 		 1070 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  34.06 
 
 		 922 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  32 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  34.22 
 
 		 1048 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2529  RNAse G  30.89 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  32 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  32 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  30.13 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1064  ribonuclease  33.63 
 
 		 977 aa  228  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.973146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  31.19 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  33.41 
 
 		 1080 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2197  ribonuclease G  31.52 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  31.67 
 
 		 485 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  29.62 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2395  ribonuclease, Rne/Rng family  31.52 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  33.66 
 
 		 953 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  31.29 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  35.04 
 
 		 1123 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  33.25 
 
 		 974 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  34.14 
 
 		 717 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  33.65 
 
 		 991 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  34.72 
 
 		 1113 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  33.65 
 
 		 991 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1995  ribonuclease, Rne/Rng family  31.52 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422302  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  31.26 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  33.65 
 
 		 987 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  33.66 
 
 		 1016 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  34.91 
 
 		 879 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  33.33 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  33.66 
 
 		 1117 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  31.38 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  32.73 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  31.29 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  30.83 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35.19 
 
 		 1194 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  31.08 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1579  ribonuclease, Rne/Rng family  33.17 
 
 		 1060 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00521114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  31.08 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  32.45 
 
 		 1061 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1061 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1068 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  32.69 
 
 		 808 aa  224  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1067 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3507  ribonuclease E  32.93 
 
 		 1216 aa  224  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0058516  normal  0.0230667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1061 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1067 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1067 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  32.45 
 
 		 1057 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>