More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0806 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 680 aa  1370    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 643 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 		 643 aa  355  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0379  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 686 aa  307  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.27 
 
 		 770 aa  270  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32.15 
 
 		 763 aa  261  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.69 
 
 		 638 aa  260  5.0000000000000005e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.95 
 
 		 714 aa  260  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.14 
 
 		 732 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.37 
 
 		 714 aa  258  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.94 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.94 
 
 		 735 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 691 aa  254  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 775 aa  251  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.94 
 
 		 727 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 		 727 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.27 
 
 		 734 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  31.86 
 
 		 641 aa  249  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.34 
 
 		 739 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 		 728 aa  247  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  31.41 
 
 		 728 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  31.74 
 
 		 734 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  31.57 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  31.69 
 
 		 680 aa  244  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 667 aa  243  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  31.15 
 
 		 679 aa  243  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 		 646 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.09 
 
 		 751 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  30.84 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.94 
 
 		 642 aa  241  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 718 aa  241  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  30.84 
 
 		 680 aa  241  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  31.64 
 
 		 714 aa  240  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  28.77 
 
 		 651 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  31.81 
 
 		 780 aa  240  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.17 
 
 		 669 aa  239  9e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  30.84 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  29.44 
 
 		 724 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  31.35 
 
 		 796 aa  238  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 673 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  29.23 
 
 		 724 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  30.6 
 
 		 679 aa  237  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.4 
 
 		 642 aa  238  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  32.28 
 
 		 750 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  31.47 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  31.09 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 718 aa  236  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  32.23 
 
 		 796 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  30.3 
 
 		 655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  33.73 
 
 		 759 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  32.01 
 
 		 778 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.27 
 
 		 661 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.97 
 
 		 685 aa  233  9e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 741 aa  233  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  29.42 
 
 		 769 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  29.6 
 
 		 757 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  30.94 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  32.68 
 
 		 772 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 806 aa  232  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  33.89 
 
 		 814 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  30.78 
 
 		 777 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  31.54 
 
 		 777 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  29.82 
 
 		 791 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  30.35 
 
 		 768 aa  231  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  30.8 
 
 		 723 aa  231  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.99 
 
 		 779 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  28.7 
 
 		 750 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  31.94 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 784 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 765 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  28.91 
 
 		 757 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  30.54 
 
 		 760 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  29.4 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.8 
 
 		 679 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.43 
 
 		 905 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  33.15 
 
 		 776 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  31.78 
 
 		 643 aa  227  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  31.78 
 
 		 643 aa  227  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 760 aa  227  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.32 
 
 		 776 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  29.4 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  31.06 
 
 		 705 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.62 
 
 		 827 aa  226  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  30.68 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  32.77 
 
 		 830 aa  225  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  31.62 
 
 		 827 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  30.51 
 
 		 774 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  32.89 
 
 		 774 aa  224  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 		 779 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  30.25 
 
 		 759 aa  224  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 648 aa  224  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  30.56 
 
 		 772 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>