More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0379 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0379  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
635 aa  1267    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  44.02 
 
 
686 aa  542  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
643 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
680 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.26 
 
 
751 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.2 
 
 
732 aa  239  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.66 
 
 
734 aa  238  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  32.73 
 
 
768 aa  237  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.11 
 
 
720 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  31.2 
 
 
714 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  31.78 
 
 
735 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.64 
 
 
734 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  29.85 
 
 
728 aa  228  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.21 
 
 
739 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  30.81 
 
 
712 aa  228  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.09 
 
 
728 aa  227  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 
714 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  31.87 
 
 
741 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  30.73 
 
 
727 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.73 
 
 
727 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33 
 
 
646 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.7 
 
 
642 aa  221  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.25 
 
 
757 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 
760 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  29.56 
 
 
757 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  29.52 
 
 
759 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 
784 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  30.6 
 
 
691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  31.56 
 
 
765 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 
641 aa  217  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  32.69 
 
 
791 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.29 
 
 
618 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 
770 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  30.98 
 
 
790 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  32.5 
 
 
754 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  29.94 
 
 
724 aa  214  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  30.13 
 
 
724 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  31.74 
 
 
744 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.61 
 
 
776 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 
676 aa  214  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.43 
 
 
779 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  29.74 
 
 
718 aa  212  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.64 
 
 
642 aa  212  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 
795 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.66 
 
 
640 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 
769 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  29.16 
 
 
687 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 
755 aa  212  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.73 
 
 
638 aa  212  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  31.03 
 
 
718 aa  211  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.35 
 
 
776 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.23 
 
 
655 aa  211  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  32.34 
 
 
644 aa  211  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  29.02 
 
 
750 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  29.61 
 
 
760 aa  211  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  29.58 
 
 
679 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  29.19 
 
 
759 aa  209  9e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  30.59 
 
 
796 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  31.72 
 
 
669 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  31.08 
 
 
720 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  28.09 
 
 
709 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  28.39 
 
 
712 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  28.71 
 
 
742 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 
730 aa  207  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  32 
 
 
763 aa  206  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  29.74 
 
 
701 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  29.98 
 
 
796 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.2 
 
 
640 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  28.99 
 
 
758 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 
661 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  30.22 
 
 
643 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.04 
 
 
645 aa  203  7e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  30.54 
 
 
768 aa  203  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  29.26 
 
 
744 aa  203  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  30.27 
 
 
714 aa  203  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  31.58 
 
 
643 aa  203  9e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  31.58 
 
 
643 aa  203  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  30.66 
 
 
777 aa  203  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  28.96 
 
 
654 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.54 
 
 
806 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  28.05 
 
 
651 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  31.04 
 
 
723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  31.5 
 
 
810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  28.5 
 
 
706 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  28.65 
 
 
709 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  30.61 
 
 
815 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  28.62 
 
 
626 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 
693 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  30.8 
 
 
811 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.63 
 
 
833 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  28.93 
 
 
750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  30.35 
 
 
712 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  30.47 
 
 
648 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  31.29 
 
 
648 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  29.77 
 
 
777 aa  197  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  29.67 
 
 
764 aa  197  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  28.28 
 
 
765 aa  197  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  28.68 
 
 
769 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  30.17 
 
 
712 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>