More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0488 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
576 aa  1183    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  39.34 
 
 
609 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
604 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
604 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  33.04 
 
 
609 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
560 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
557 aa  276  6e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 
557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
636 aa  257  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
559 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  31.18 
 
 
572 aa  240  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  29.87 
 
 
580 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  30.6 
 
 
587 aa  225  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
531 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 
627 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 
557 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
597 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 
548 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
548 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  27.39 
 
 
565 aa  154  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  27.04 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 
569 aa  148  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.24 
 
 
564 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  27.8 
 
 
560 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 
547 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.59 
 
 
551 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 
567 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  31.19 
 
 
366 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 
540 aa  135  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 
568 aa  133  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 
576 aa  131  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  25.73 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  25.39 
 
 
560 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  25.71 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.95 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  25.09 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  24.66 
 
 
565 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 
567 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0631  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
611 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.833854  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  25.64 
 
 
557 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  22.61 
 
 
545 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 
579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.97 
 
 
556 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
562 aa  117  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  25.72 
 
 
568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.35 
 
 
563 aa  114  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  24.35 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0238  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
654 aa  109  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.236322  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
510 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0162  extracellular solute-binding protein family 5  23.34 
 
 
620 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000359667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
633 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0906  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
659 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 
529 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
522 aa  103  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.55 
 
 
520 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
539 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.14 
 
 
525 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.45 
 
 
524 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  27.11 
 
 
527 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
634 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
505 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5891  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
634 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3951  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 
633 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  23.33 
 
 
577 aa  98.6  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1189  extracellular solute-binding protein family 5  24.53 
 
 
621 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.105584  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
512 aa  95.9  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3320  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
528 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0123121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
541 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.19 
 
 
563 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 
625 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0485  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
619 aa  92.8  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.1 
 
 
529 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
529 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
579 aa  91.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
625 aa  91.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.58 
 
 
528 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
611 aa  91.3  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
530 aa  91.3  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  23.57 
 
 
527 aa  90.9  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
524 aa  90.5  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.21 
 
 
528 aa  90.1  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.4 
 
 
529 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
622 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.05 
 
 
529 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 
604 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
544 aa  88.6  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0531  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
626 aa  88.6  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0786  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  23.82 
 
 
537 aa  87.8  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527095  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0535  putative peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.9 
 
 
611 aa  87.4  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  24.41 
 
 
594 aa  87  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.85 
 
 
528 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.54 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
527 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>