More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1765 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1765  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 586 aa  1134    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 662 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  38.92 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  37.97 
 
 		 1159 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  38.44 
 
 		 487 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1167 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  37.72 
 
 		 1159 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1174 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  40.16 
 
 		 633 aa  203  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 1177 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  35.88 
 
 		 1148 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1172 aa  200  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  36.8 
 
 		 1157 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 1055 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  35.16 
 
 		 591 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 		 634 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 817 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  38.82 
 
 		 604 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1159 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.81 
 
 		 854 aa  194  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  36.1 
 
 		 441 aa  193  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 1147 aa  193  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  35.04 
 
 		 1169 aa  193  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1159 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1156 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 653 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  35.97 
 
 		 1174 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  33.78 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1316 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1140 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1177 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 1170 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1168 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 609 aa  190  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1169 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 589 aa  190  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 854 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1158 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 655 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 1168 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 744 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1145 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 662 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3605  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 610 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 675 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1146 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  32.66 
 
 		 593 aa  187  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1146 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1159 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 		 1145 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  31.3 
 
 		 1142 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  32.82 
 
 		 1146 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.41 
 
 		 1158 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1172 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.47 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1146 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1146 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 1169 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  35.25 
 
 		 1169 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1146 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 1140 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1171 aa  183  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  33.51 
 
 		 842 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1146 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 574 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1159 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 816 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 1169 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  37.99 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1169 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 1145 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  35.19 
 
 		 1161 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1163 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1138 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  31.57 
 
 		 1141 aa  177  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.38 
 
 		 1156 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.05 
 
 		 1445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  33.93 
 
 		 1150 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  38.13 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2327  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  30.49 
 
 		 666 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 856 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 545 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 556 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1152 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  34.86 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1152 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1930  histidine kinase  32.84 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.592963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 567 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  34.55 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  38.56 
 
 		 594 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 540 aa  170  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 554 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  32.11 
 
 		 1147 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  36.31 
 
 		 448 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  35.88 
 
 		 868 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1140 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>