More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1647 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  28.24 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  19.79 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>