233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0893 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  710    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.62 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  46.67 
 
 
329 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  45.45 
 
 
380 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.56 
 
 
374 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.77 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  51.61 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  49.67 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  45.67 
 
 
344 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  49.68 
 
 
344 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.04 
 
 
352 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  43.02 
 
 
339 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  45.13 
 
 
341 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  48.41 
 
 
339 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  46.82 
 
 
351 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  46.98 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  43.52 
 
 
333 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  44.59 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  44.97 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  44.66 
 
 
338 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  45.63 
 
 
338 aa  271  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.37 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  44.48 
 
 
322 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  48.15 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.06 
 
 
336 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  43.81 
 
 
322 aa  261  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.14 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  45.79 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.97 
 
 
343 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.65 
 
 
337 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.89 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  46.28 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  42.55 
 
 
328 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.28 
 
 
328 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  32.44 
 
 
364 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  36.76 
 
 
347 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.77 
 
 
322 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  27.53 
 
 
1065 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  28.37 
 
 
856 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  29.37 
 
 
328 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.24 
 
 
1075 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  27.95 
 
 
335 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  28.3 
 
 
821 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.99 
 
 
375 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 
1004 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.53 
 
 
674 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
915 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  28.11 
 
 
794 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  30.91 
 
 
357 aa  96.3  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  27.1 
 
 
593 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.4 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1004 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.04 
 
 
342 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  25.77 
 
 
893 aa  93.2  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.15 
 
 
1238 aa  93.2  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.53 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.63 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.71 
 
 
686 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.08 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.56 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.03 
 
 
778 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  25.82 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.47 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.95 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.78 
 
 
721 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.67 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.44 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.48 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.29 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  26.41 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.1 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.29 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.39 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  23.79 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.33 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.1 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.39 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  19.28 
 
 
344 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.03 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.03 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  28.14 
 
 
334 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.39 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  27.71 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.56 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  24.71 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  24.71 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  27.69 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.14 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  25.19 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  24.83 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>