More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0676 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  44.41 
 
 
289 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  43.18 
 
 
307 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  42.25 
 
 
283 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  42.27 
 
 
307 aa  225  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  44.44 
 
 
296 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  38.72 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  41.4 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  38.41 
 
 
327 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  42.95 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  38.41 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  41.22 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  39.23 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  40.88 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  41.79 
 
 
310 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  42.57 
 
 
304 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  35.42 
 
 
345 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  38.75 
 
 
401 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  40.91 
 
 
298 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  40.91 
 
 
298 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  42.2 
 
 
294 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  39.53 
 
 
298 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  38.49 
 
 
309 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  35.63 
 
 
344 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  40.4 
 
 
298 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  41.26 
 
 
298 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  36.07 
 
 
363 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  40.35 
 
 
296 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  43.94 
 
 
377 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  41.18 
 
 
377 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  41.18 
 
 
377 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  41.18 
 
 
377 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  41.18 
 
 
377 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  35.79 
 
 
363 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  43.89 
 
 
374 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  39.33 
 
 
379 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  39.33 
 
 
379 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  39.33 
 
 
379 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  39.33 
 
 
379 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  41.54 
 
 
328 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  39.33 
 
 
379 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  43.4 
 
 
311 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  42.36 
 
 
298 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  39 
 
 
379 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  39 
 
 
379 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  41.22 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  37.58 
 
 
404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  44.17 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  37.85 
 
 
304 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.07 
 
 
262 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  40.7 
 
 
288 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  42.7 
 
 
262 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  36.52 
 
 
249 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  41.27 
 
 
284 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  39.3 
 
 
288 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  39.06 
 
 
293 aa  188  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  38.62 
 
 
285 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  38.38 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  38.56 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  38.38 
 
 
251 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  38.38 
 
 
251 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  38.38 
 
 
251 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  38.38 
 
 
251 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  38.38 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  36.49 
 
 
257 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  37.02 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  37.02 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  37.02 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  36.97 
 
 
251 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  39.09 
 
 
250 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  36.97 
 
 
251 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  36.97 
 
 
251 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  35.59 
 
 
293 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  38.68 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  39.24 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  38.25 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  38.01 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.68 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  34.28 
 
 
230 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  36.17 
 
 
246 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  34.28 
 
 
230 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  34.97 
 
 
333 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  37.28 
 
 
265 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  39.66 
 
 
230 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  36.24 
 
 
298 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  39.66 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  39.24 
 
 
236 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  38.82 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  33.33 
 
 
315 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  35.03 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  39.08 
 
 
261 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  32.99 
 
 
264 aa  162  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  38.82 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.82 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  38.82 
 
 
233 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.82 
 
 
233 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.82 
 
 
233 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  38.82 
 
 
233 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  33.85 
 
 
360 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>