More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3023 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3023  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 256 aa  523  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.04005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4899  tryptophan synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 253 aa  316  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  55.64 
 
 		 258 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08026  tryptophan synthase alpha chain  56.12 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3798  tryptophan synthase, alpha subunit  50.77 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3297  tryptophan synthase subunit alpha  53.49 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.754487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5480  tryptophan synthase, alpha subunit  51.74 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.428541 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  37.11 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  37.7 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0683  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.550176 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0501  tryptophan synthase subunit alpha  36.12 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0623201  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  36.18 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  35.41 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 271 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0840  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1315  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1136  tryptophan synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1399  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1322  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1162  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.798921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1050  tryptophan synthase, alpha subunit  33.58 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1254  tryptophan synthase subunit alpha  36.86 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4047  tryptophan synthase subunit alpha  36.93 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  34.6 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1142  tryptophan synthase subunit alpha  36.47 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0786  tryptophan synthase subunit alpha  34.09 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0265474  normal  0.221599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  38.28 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  39.26 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.75 
 
 		 700 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1150  tryptophan synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  34.12 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1362  tryptophan synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  38.04 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  36.97 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0990  tryptophan synthase subunit alpha  37.34 
 
 		 290 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0545  tryptophan synthase subunit alpha  35.1 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153756  normal  0.598011 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  35.02 
 
 		 723 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  36.58 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1297  tryptophan synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  35.88 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.71 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.29 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  36.02 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  37.18 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  37.66 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  37.65 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  33.84 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  33.97 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  35.77 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  35.8 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  35.86 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1933  tryptophan synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.85 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  34.62 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  37.92 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  36.72 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  36.72 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2127  tryptophan synthase, alpha subunit  36.51 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  35.4 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 268 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  34.31 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  36.51 
 
 		 268 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  36 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  35.18 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  37.13 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  33.33 
 
 		 302 aa  155  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  33.21 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  34.73 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 278 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  37.08 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  37.85 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  34.73 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39.64 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  36.67 
 
 		 279 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  35.96 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  35.37 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  36.55 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>