176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0680 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 384 aa  743    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  24.35 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  24.36 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  21.72 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1254  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.01739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  22.87 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  22.9 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  21.04 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  22.87 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  22.87 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2603  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1556  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 398 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  26.71 
 
 		 432 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2745  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382719  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  22.59 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  25.89 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1331  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107576  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  27.82 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  28 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  30 
 
 		 516 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  25.68 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 460 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  27.82 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5461  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  38.05 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.293295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4913  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  38.05 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.283343  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0053  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.59 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4944  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1812  transporter, major facilitator family  23.81 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1491  major facilitator family transporter  23.81 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0164303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1983  major facilitator family transporter  23.71 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31240  Major facilitator superfamily protein  28.33 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1472  major facilitator family protein  23.81 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1456  transporter major facilitator family  23.81 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0765913  normal  0.139077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 454 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1137  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  27.31 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  24.93 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02690  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  31.78 
 
 		 458 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5226  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  36.28 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0158809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3127  transport protein  22.22 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5633  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  36.28 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  decreased coverage  0.00133804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4596  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  36.28 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280784  hitchhiker  0.00129913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  31.78 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01691  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 		 521 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.02998  normal  0.0975408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  23.73 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  27.81 
 
 		 476 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3217  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  32.5 
 
 		 401 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.636967  normal  0.114002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  26.34 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02900  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.66 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278203 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  31.39 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1505  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.890529  hitchhiker  0.000754157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0321  4-hydroxybenzoate transporter PcaK  33.66 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6976  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01660  predicted transporter  22.55 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  26.37 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1837  fucose permease  25.1 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0765737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2304  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  33.33 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1940  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>