56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0113 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  778    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  39.67 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 417 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  24.18 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.24 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0291  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.43 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.87 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  26 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  28.36 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 480 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  28.36 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 375 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  30.99 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  27.24 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  35.46 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.15 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  32.81 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4034  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.66 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12484  integral membrane transport protein  27.7 
 
 		 523 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  27.63 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  31.7 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  31.7 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  31.7 
 
 		 394 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  23.6 
 
 		 466 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  24.57 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.57 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  28.22 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>