68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3249 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  100 
 
 		 385 aa  723    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 391 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  31.7 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  29.89 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  36.18 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  31.87 
 
 		 431 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  30.49 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  26.37 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  34.29 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1638  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.97 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0050  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  26.77 
 
 		 372 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3406  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2963  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.798243  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2902  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3830  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.852722  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3911  putative amino acid ABC transporter, permease protein  28.5 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  29.59 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4341  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0193  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0206  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3978  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30.32 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 465 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  27.76 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  28.19 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  28.97 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 439 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 394 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  26.25 
 
 		 383 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>