41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2047 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  765    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 405 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  34.23 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 485 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 385 aa  99.8  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.49 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  22.4 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  27.16 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.4 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  29.56 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  27.47 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3998  major facilitator superfamily transporter  25.61 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00916117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.53 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.27 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  22.22 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  25.45 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  29.19 
 
 		 514 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.07 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.87 
 
 		 409 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>