23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4481 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  706    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  35.56 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  29.95 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  25.12 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2563  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0859  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.26 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1146  major facilitator superfamily permease  24.22 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.77 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>