49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8922 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  100 
 
 		 385 aa  726    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 485 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.4 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.58 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  29.52 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  25 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  30.47 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  25.13 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  25.13 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  25.13 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  35.6 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  25.13 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  28.85 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 470 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  30.63 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.33 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  29.38 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  29.38 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  29.38 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  29.38 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 433 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  28.75 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 404 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>