13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8086 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8086  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 485 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0113  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8922  Arabinose efflux permease-like protein  43.68 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0872  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4585  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2047  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3249  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3472  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.2382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4481  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  28.12 
 
 		 401 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>