178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4341 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4341  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  738    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1471  major facilitator superfamily transporter  30.67 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  27.07 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  30.73 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  24.78 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  27.15 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4332  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.823836 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  30.33 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.67 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.49 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  29.85 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2486  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  28.3 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0828  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  29.95 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  29.94 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  26.14 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  24.32 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  28.87 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  29.23 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3207  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5733  major facilitator superfamily MFS_1  30.74 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  29.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  29.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  29.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  29.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  29.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5300  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  29.15 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  30 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  31.02 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  30.94 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3793  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.510326  normal  0.658705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0187  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000715717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0261  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.989591 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  28.37 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  29.51 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0396  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0279  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.928738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  25.93 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  28.37 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  28.37 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>