196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2047 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  93.26 
 
 
282 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  69.11 
 
 
259 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  68.36 
 
 
258 aa  329  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  65.52 
 
 
258 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  63.46 
 
 
259 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  65.52 
 
 
258 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  65.52 
 
 
258 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  65.52 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  65.52 
 
 
258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  63.08 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  66.28 
 
 
257 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  62.93 
 
 
259 aa  292  4e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  43.18 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  42.97 
 
 
287 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  43.24 
 
 
268 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  41.07 
 
 
261 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  41.37 
 
 
254 aa  168  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  38.08 
 
 
258 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  36.33 
 
 
254 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  34.67 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  34.15 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  34.11 
 
 
252 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  34.38 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  34.15 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  38.57 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 
260 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  32.94 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  112  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  33.98 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  33.98 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  34.14 
 
 
242 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  33.6 
 
 
264 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  33.73 
 
 
251 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.48 
 
 
280 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  33.63 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.59 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.88 
 
 
267 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  32.94 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  33.08 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.79 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.5 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  34.52 
 
 
244 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  30.45 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  32.22 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.4 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  31.46 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  29.43 
 
 
264 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  33.73 
 
 
244 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.57 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.28 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.3 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
278 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.71 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  29.85 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.19 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.68 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.22 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.88 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.16 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.95 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.16 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.97 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  30.92 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.05 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  26.7 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.99 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.26 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  26.61 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.31 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.81 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  30.18 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  30.95 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.18 
 
 
219 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  27.09 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.59 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  32.89 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  30.5 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.33 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  31.99 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.21 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.48 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.22 
 
 
252 aa  62.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  32.29 
 
 
271 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>