183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0519 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0519  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  50.34 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  50.34 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3116  hypothetical protein  50.36 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  44.14 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  49.21 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3425  hypothetical protein  42.18 
 
 		 265 aa  98.2  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.130437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  34.27 
 
 		 145 aa  88.2  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  34.81 
 
 		 147 aa  84.3  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  34.88 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.76 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  42.03 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  37.8 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  39.46 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  30.34 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3051  hypothetical protein  37.21 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36.91 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  40.97 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  39.04 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  37.3 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  35.17 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  38.14 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  34.04 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0513  protein of unknown function DUF461  37.61 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15120  hypothetical protein  37.29 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0842048  hitchhiker  0.000317485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  29.66 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00576  hypothetical protein  35.38 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  36.91 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  37.72 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.84 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  36.21 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  32.64 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  39.06 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3619  hypothetical protein  34.81 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3957  hypothetical protein  34.81 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140419  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  35.43 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  36.51 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  35.2 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  33.58 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  37.62 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  38.79 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  34.68 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  38.79 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  33.85 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.29 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  39.52 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  35.34 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  37.96 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  31.97 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  31.97 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  30.83 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  32.22 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0817  D-alanine--D-alanine ligase  30.56 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  35.96 
 
 		 320 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1571  hypothetical protein  40.74 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  32.39 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.25 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  35.66 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1601  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1625  hypothetical protein  39.81 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2158  hypothetical protein  38.98 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.25 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  31.62 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  30.56 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  35.77 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  31.91 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  36.08 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  32.73 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3228  hypothetical protein  33.81 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00349647  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  34.45 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4208  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.438596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1778  protein of unknown function DUF461  34.29 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  36.89 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  34.29 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  36.89 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  35.77 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  32.03 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2787  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0142932  decreased coverage  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  36.11 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  32.26 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  62  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  36.89 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  37.8 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1731  protein of unknown function DUF461  32.71 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  37.3 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  33.9 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  36.21 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>