208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2088 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  60.13 
 
 		 160 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  57.96 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  54.14 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  52.9 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  54.14 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  50.31 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  46.84 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  53.12 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  50.32 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  48.72 
 
 		 294 aa  165  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  49.67 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  49.36 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  48.41 
 
 		 171 aa  144  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  46.58 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  44.14 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  46.85 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  45.07 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  44.3 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  46.85 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.45 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  44.3 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  45 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 155 aa  117  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  45.07 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  41.41 
 
 		 135 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  43.97 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  39.57 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  41.89 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.31 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  40.97 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.16 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  41.83 
 
 		 241 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40 
 
 		 237 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  35.82 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  37.59 
 
 		 151 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  37.74 
 
 		 251 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  38.64 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  38.64 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  46.03 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  45.83 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  37.12 
 
 		 167 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  39.07 
 
 		 239 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.13 
 
 		 138 aa  94.4  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  42.25 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  39.39 
 
 		 145 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  40.67 
 
 		 231 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  40.85 
 
 		 230 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  38.06 
 
 		 240 aa  92  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  38.03 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  39.86 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  31.77 
 
 		 336 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  38.93 
 
 		 129 aa  90.1  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  37.66 
 
 		 240 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  40 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  40.14 
 
 		 231 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  33.14 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  33.59 
 
 		 311 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.4 
 
 		 145 aa  88.6  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  40.6 
 
 		 138 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  39.53 
 
 		 142 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.06 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  33.13 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  39.44 
 
 		 230 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  36.05 
 
 		 235 aa  84.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  38.73 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  35.71 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  41.18 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  38.24 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  38.73 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  36.18 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  35.06 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  36.05 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  35.86 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  34.84 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2751  hypothetical protein  36.08 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  36.08 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  33.93 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  33.72 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  34.01 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  37.16 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  32.56 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  32.72 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  32.72 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  32.72 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  32.72 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  31.58 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  33.94 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  34.03 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  31.58 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>