More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1124 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  100 
 
 		 338 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  72.4 
 
 		 338 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  34.43 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  34.41 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  31.48 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  35.49 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.84 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  26.75 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.73 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 340 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  22.74 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.62 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  26.02 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  26.55 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  22.15 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  23.68 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 873 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  33.61 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.38 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2353  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  21.69 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.58 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.2 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.46 
 
 		 561 aa  63.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.53 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  22.29 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  26.22 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.22 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.22 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  25.83 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  25.83 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  32.58 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  19.52 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 281 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  31.58 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  22.04 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  22.3 
 
 		 367 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  28.76 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.77 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.36 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.56 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  22.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.06 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 496 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  24.54 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.67 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.56 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 445 aa  53.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>