More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1643 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1450  hypothetical protein  68.17 
 
 		 863 aa  1086    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  66.67 
 
 		 860 aa  1115    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1726    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  65.1 
 
 		 869 aa  1093    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  33.45 
 
 		 934 aa  399  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  25.77 
 
 		 836 aa  170  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  28.92 
 
 		 825 aa  167  9e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.09 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  28.06 
 
 		 770 aa  154  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  29.94 
 
 		 682 aa  151  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  30.27 
 
 		 576 aa  150  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  27.22 
 
 		 710 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  27.99 
 
 		 723 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  30.43 
 
 		 699 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  27.66 
 
 		 717 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  26.78 
 
 		 832 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  26.59 
 
 		 758 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  28.02 
 
 		 702 aa  133  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  24.91 
 
 		 738 aa  131  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  27.47 
 
 		 724 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  26.95 
 
 		 730 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  26.39 
 
 		 723 aa  130  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.6 
 
 		 740 aa  130  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  25.55 
 
 		 741 aa  130  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  29.92 
 
 		 699 aa  129  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  25.42 
 
 		 1155 aa  129  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  26.69 
 
 		 738 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  29.5 
 
 		 745 aa  128  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  28.7 
 
 		 709 aa  127  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  34.13 
 
 		 1077 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  24.07 
 
 		 737 aa  127  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  27.79 
 
 		 719 aa  127  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  26.26 
 
 		 842 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  26.58 
 
 		 737 aa  126  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  34.29 
 
 		 1146 aa  126  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  22.43 
 
 		 730 aa  124  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  23.61 
 
 		 730 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  24.02 
 
 		 730 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  24.02 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  24.02 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  24.02 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  27.31 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  29.71 
 
 		 674 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  29.71 
 
 		 674 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7301  MmpL domain-containing protein  25.85 
 
 		 704 aa  123  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.573175  normal  0.0728725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  24.02 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  23.83 
 
 		 758 aa  122  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  46.1 
 
 		 1013 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  22.17 
 
 		 730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  23.62 
 
 		 730 aa  121  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  25.43 
 
 		 829 aa  121  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  25.43 
 
 		 829 aa  121  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  24.92 
 
 		 882 aa  120  9e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  33.49 
 
 		 974 aa  120  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  29.32 
 
 		 674 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  27.84 
 
 		 753 aa  119  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  25.55 
 
 		 743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.91 
 
 		 726 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  26.17 
 
 		 738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  25.64 
 
 		 731 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  26.51 
 
 		 734 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  24.22 
 
 		 743 aa  116  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  25.83 
 
 		 794 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  23.53 
 
 		 713 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  24.42 
 
 		 731 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  25.79 
 
 		 733 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  38.65 
 
 		 1002 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  27.45 
 
 		 780 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 953 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  40.96 
 
 		 750 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  24.42 
 
 		 736 aa  113  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  24.24 
 
 		 761 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  34.21 
 
 		 981 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.18 
 
 		 724 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  27.14 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  30.04 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  27.25 
 
 		 743 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  23.18 
 
 		 730 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  26.98 
 
 		 712 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  24.4 
 
 		 704 aa  111  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  30.49 
 
 		 775 aa  111  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  24.16 
 
 		 1013 aa  111  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 		 974 aa  110  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  28.36 
 
 		 948 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  40.94 
 
 		 1062 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  32.77 
 
 		 959 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  40.94 
 
 		 1062 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  24.21 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  23.61 
 
 		 978 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  34.78 
 
 		 998 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  34.04 
 
 		 945 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  34.04 
 
 		 945 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  34.78 
 
 		 998 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  34.78 
 
 		 998 aa  109  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  38.6 
 
 		 1001 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  25.05 
 
 		 755 aa  109  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  28.11 
 
 		 941 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  23.73 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  24.81 
 
 		 805 aa  108  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  27.26 
 
 		 731 aa  108  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>