More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1607 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  100 
 
 		 572 aa  1145    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  61.09 
 
 		 553 aa  677    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  57.27 
 
 		 568 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  55.79 
 
 		 568 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.59 
 
 		 659 aa  327  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  38.03 
 
 		 670 aa  296  7e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1885  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.71 
 
 		 646 aa  282  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  45.81 
 
 		 245 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.44 
 
 		 250 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 245 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  33.33 
 
 		 245 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  42.13 
 
 		 242 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.47 
 
 		 240 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  42.33 
 
 		 252 aa  117  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.92 
 
 		 245 aa  115  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  41.9 
 
 		 281 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  39.09 
 
 		 264 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.99 
 
 		 249 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2024  glutamate synthase alpha subunit  39.11 
 
 		 246 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  41.8 
 
 		 251 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2490  glutamate synthase alpha subunit  39.11 
 
 		 248 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  38.54 
 
 		 245 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  39.66 
 
 		 251 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0025  glutamine amidotransferase class-II  31 
 
 		 365 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  36.87 
 
 		 248 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  38.2 
 
 		 247 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  27.8 
 
 		 263 aa  101  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  27.44 
 
 		 256 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  32.34 
 
 		 256 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0665  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.34 
 
 		 350 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  35.08 
 
 		 246 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1300  glutamine amidotransferase class-II  28.69 
 
 		 361 aa  99  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16310  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  30.8 
 
 		 355 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000470863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.08 
 
 		 256 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2710  glutamine amidotransferase class-II  29.6 
 
 		 350 aa  97.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0780  glutamine amidotransferase, class-II  28.02 
 
 		 350 aa  97.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0619068  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1753  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.42 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.33 
 
 		 248 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  28.02 
 
 		 261 aa  94.7  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1293  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  25.42 
 
 		 368 aa  94.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.75 
 
 		 247 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2136  glutamine amidotransferase, class-II  31.43 
 
 		 382 aa  93.2  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2361  glutamine amidotransferase class-II  28.57 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2491  glutamine amidotransferase, class-II  29.02 
 
 		 371 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1815  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.51 
 
 		 364 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0558  glutamine amidotransferase, class-II  29.33 
 
 		 374 aa  91.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1690  glutamine amidotransferase, class-II  28.7 
 
 		 349 aa  91.3  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.491949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0522  glutamine amidotransferase, class-II  29.07 
 
 		 395 aa  89.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0536  glutamine amidotransferase class-II  29.07 
 
 		 372 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0213  glutamine amidotransferase, class-II  27.02 
 
 		 378 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1092  glutamine amidotransferase class-II  26.94 
 
 		 363 aa  89  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1236  hypothetical protein  28.7 
 
 		 339 aa  88.6  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0869  glutamine amidotransferase class-II  25.55 
 
 		 363 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0521916  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1598  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  26.91 
 
 		 363 aa  87.8  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1078  glutamine amidotransferase class-II  27.2 
 
 		 363 aa  87.4  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0197  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  28.83 
 
 		 363 aa  87.4  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.480827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1127  hypothetical protein  36.09 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000223973  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0334  glutamine amidotransferase, class-II  30.73 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_945  glutamate synthase-like protein protein, alpha subunit-like protein  36.09 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0956  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.69 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0545  glutamine amidotransferase class-II  28.24 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405824 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_948  glutamine amidotransferase, class II  27.8 
 
 		 376 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0959  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  27.85 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1130  glutamine amidotransferase, class II  26.01 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1338  glutamine amidotransferase, class-II  26.34 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.845818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2026  glutamine amidotransferase, class-II  26.32 
 
 		 359 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.805771  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.23 
 
 		 1475 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  34.23 
 
 		 1475 aa  67.4  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.14 
 
 		 1530 aa  67  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  41.88 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.78 
 
 		 1519 aa  64.7  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.2 
 
 		 1533 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0992  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  28.11 
 
 		 602 aa  63.5  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.22 
 
 		 1521 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.82 
 
 		 1502 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.03 
 
 		 1527 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.88 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0921  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  30.95 
 
 		 604 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.28 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0383  glutamate synthase alpha subunit domain protein  29.81 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  27.57 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  34.95 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.8 
 
 		 1473 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  28.9 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.25 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.59 
 
 		 1474 aa  60.1  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0394  amidophosphoribosyltransferase  28.3 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0144451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  27.1 
 
 		 1487 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1693  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.37 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.457589  normal  0.0574833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  26.26 
 
 		 1524 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  31.71 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0270  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  27.44 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  29.22 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  38.46 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.64 
 
 		 1479 aa  58.2  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  28.24 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>