66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3681 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3681  SapC  100 
 
 		 258 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  58.98 
 
 		 256 aa  324  7e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0151  hypothetical protein  41.32 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.681081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  37.83 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  35.65 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  34.22 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  39.29 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  33.62 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  29.18 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  31.36 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  31.25 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  37.56 
 
 		 236 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  32.62 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  31.49 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  30.9 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  32.3 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  29.65 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  35.09 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1024  hypothetical protein  30.32 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  29.46 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  34.65 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  32.89 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02804  SapC  30.22 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  34.65 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  27.78 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  30.47 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  31.13 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3684  hypothetical protein  28.74 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  28.63 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3736  hypothetical protein  27.71 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3838  SapC family protein  28.69 
 
 		 242 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  27.35 
 
 		 240 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  27.35 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  27.35 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1261  VCBS  25.68 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  27.78 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0916  SapC  30.94 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1102  SapC related protein  27.35 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02200  SapC superfamily  28.26 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1311  SapC family protein  25.21 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  27.71 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  29.88 
 
 		 273 aa  97.8  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  27.2 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  29.66 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1605  SapC  27.95 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2545  SapC  27.19 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1963  SapC  27.27 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.78249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1399  hypothetical protein  27.59 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  29.6 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  27.8 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0659  SapC protein, putative  27.31 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0131187  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  25.74 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  27.23 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  26.11 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  26.67 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2408  SapC family protein  26.37 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000281595  normal  0.323308 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  29.46 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0026  SapC  24.38 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0137  SapC family protein  26.38 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.459538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  25.64 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1947  SapC family protein  26.55 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0836073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1289  SapC  28.51 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.369266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1048  SapC  28.26 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0951508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0917  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  24.42 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0460  SapC  29.27 
 
 		 380 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0614463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>