102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2325 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 144 aa  283  8e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  89.58 
 
 		 144 aa  266  8.999999999999999e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  89.58 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  90.28 
 
 		 144 aa  262  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  58.09 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  50.35 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  45.99 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  48.95 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  41.26 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  39.16 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  39.16 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  40.71 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  43.36 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  41.3 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  39.86 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.11 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  34.62 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.86 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  36.57 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  36.15 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  35.88 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  35.17 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  33.59 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  30.3 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  35.11 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  35.11 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  34.35 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  34.35 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  30.6 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  27.78 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  38.37 
 
 		 404 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 354 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 485 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  30.89 
 
 		 366 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  28.08 
 
 		 382 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  37.21 
 
 		 373 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  27.62 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  30.61 
 
 		 401 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  29.73 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  30.08 
 
 		 366 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 481 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 484 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 344 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  35.63 
 
 		 382 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 337 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  39.53 
 
 		 493 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 333 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 327 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  32.14 
 
 		 358 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 331 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 380 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 344 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 493 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  32.61 
 
 		 405 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 344 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  39.22 
 
 		 548 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 467 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 471 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 368 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  29.35 
 
 		 393 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 467 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  29.35 
 
 		 442 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  31.34 
 
 		 545 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  31.34 
 
 		 560 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 444 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 536 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  29.35 
 
 		 442 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  27.47 
 
 		 497 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 468 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  27.47 
 
 		 497 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 411 aa  40.8  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  30.43 
 
 		 362 aa  40.8  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  31.11 
 
 		 423 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 339 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  28.12 
 
 		 502 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 346 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  29.85 
 
 		 532 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  29.85 
 
 		 536 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  26.04 
 
 		 509 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0807  transcription elongation factor NusA  26.04 
 
 		 509 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  29.85 
 
 		 544 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  27.64 
 
 		 337 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>