More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2236 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  88.2 
 
 		 450 aa  797    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  84.48 
 
 		 451 aa  778    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  86.25 
 
 		 451 aa  789    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  100 
 
 		 450 aa  887    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  64.04 
 
 		 456 aa  598  1e-170  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  58.86 
 
 		 441 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  52.38 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  53.85 
 
 		 452 aa  435  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  51.02 
 
 		 448 aa  425  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  45.18 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  43.78 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  44.52 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  42.95 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  43.24 
 
 		 484 aa  353  4e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  42.63 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  41.57 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  40.86 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  40.53 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  38.48 
 
 		 451 aa  319  6e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.45 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  42.86 
 
 		 614 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.39 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.77 
 
 		 731 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.08 
 
 		 651 aa  51.2  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.58 
 
 		 656 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.29 
 
 		 644 aa  50.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  41.67 
 
 		 608 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 638 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 640 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 		 623 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.35 
 
 		 628 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.711705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0942  FtsH peptidase  41.18 
 
 		 630 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.61 
 
 		 647 aa  50.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  45.21 
 
 		 615 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 628 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 628 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.59 
 
 		 651 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.91 
 
 		 732 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08270  ATP-dependent metallopeptidase M41, FtsH  44.71 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 701 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  42.86 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.56 
 
 		 584 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4397  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.71 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  41.49 
 
 		 644 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10151  cell division protein FtsH4  37.5 
 
 		 584 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.745337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.71 
 
 		 618 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.16 
 
 		 631 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 731 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  40 
 
 		 628 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 642 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.47 
 
 		 676 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  38.64 
 
 		 658 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.56 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 781 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  41.56 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 784 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08411  FtsH ATP-dependent protease-like protein  40 
 
 		 637 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.89 
 
 		 608 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  41.56 
 
 		 639 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  40.7 
 
 		 630 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  43.53 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  37.65 
 
 		 691 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.27 
 
 		 781 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  43.24 
 
 		 640 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.56 
 
 		 638 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.1 
 
 		 662 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.55 
 
 		 641 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 640 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.45 
 
 		 697 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.21 
 
 		 650 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.73 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08041  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.77 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0315531  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1231  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.49 
 
 		 617 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.901618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  42.86 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  42.17 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  39.76 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  41.77 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0979  FtsH peptidase  40.43 
 
 		 641 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 616 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  43.84 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40 
 
 		 632 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.43 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.84 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10141  cell division protein FtsH4  36 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  41.77 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  43.84 
 
 		 639 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  39.76 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.59 
 
 		 657 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  38.3 
 
 		 640 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  39.08 
 
 		 620 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  38.37 
 
 		 692 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  53.06 
 
 		 639 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>