More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0383 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 337 aa  692    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  78.01 
 
 		 332 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  75.3 
 
 		 332 aa  528  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  73.89 
 
 		 337 aa  521  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  73.8 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  73.48 
 
 		 331 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  73.17 
 
 		 330 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  41.01 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  42.14 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  41.31 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  37.14 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  41.22 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  38.84 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.74 
 
 		 317 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  39.53 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.11 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  37.41 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  40.5 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  35.76 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  34.32 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  35.67 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  37.55 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  36.19 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  41.18 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  37.4 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.92 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  34.95 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  33.12 
 
 		 332 aa  166  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  33.04 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  42.06 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.72 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  31.91 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  33.03 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  35.27 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  32.99 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  31.94 
 
 		 333 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  31.94 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.44 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.72 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  30.27 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  31.61 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.72 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.34 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  30 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  33.93 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.05 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  32.85 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  33.33 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.76 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.59 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  36 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  29.23 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4194  polyprenyl synthetase  33.99 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.93 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  29.23 
 
 		 319 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.73 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0378  farnesyltranstransferase  34.53 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5471  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  32.53 
 
 		 575 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  33.43 
 
 		 334 aa  144  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  32.37 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  32.85 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  31.45 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0406  Polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 349 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  30.21 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0407  Polyprenyl synthetase  34.53 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  31.49 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.22 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  36.5 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.96 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  27.38 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.91 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.53 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  33.9 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  31.79 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  32.16 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.37 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>