More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4090 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 327 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  89.6 
 
 		 327 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4312  anti-FecI sigma factor, FecR  39.05 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  36.62 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  37.1 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  36.94 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  36.62 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  34.01 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  30.33 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  36.36 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  29.65 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  28.57 
 
 		 351 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  33.78 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2017  anti-FecI sigma factor, FecR  34.35 
 
 		 345 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  31.11 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  34.95 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4020  putative transmembrane sensor  41.75 
 
 		 268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33780  putative transmembrane sensor  32.06 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00478537  hitchhiker  0.00622545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46650  putative transmembrane sensor  41.26 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000141667  hitchhiker  0.00000417147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  33 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2564  putative FecR  30.28 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34255  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  32.46 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1968  anti-FecI sigma factor, FecR  33.23 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  33.53 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.92 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1352  putative FecR  28.79 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  27.94 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5853  anti-FecI sigma factor, FecR  33.09 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  34.93 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  32.7 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3721  anti-FecI sigma factor, FecR  33.02 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  34 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  35 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  32.11 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  31.49 
 
 		 330 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  37.18 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  34.67 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  34.67 
 
 		 338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2872  putative transmembrane sensor  31.66 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3958  putative regulatory protein  25.54 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  31.67 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  27.43 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2367  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  35.53 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  35.06 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  32.14 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1078  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  34.77 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  30.99 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  35.06 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  28.3 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  30.15 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  31.27 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  33.55 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  34.72 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2358  hypothetical protein  29.31 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0172911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  33.55 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  33.98 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  33.88 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0244  putative regulatory protein  27.69 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  30.21 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  36.36 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2125  anti-FecI sigma factor, FecR  36.8 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.94 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  31.39 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.92 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  35.56 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  34.74 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0142  anti-FecI sigma factor, FecR  31.45 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26324  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  37.75 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  32.91 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  34.29 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1860  anti-FecI sigma factor, FecR  39.9 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  33.92 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.67 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  30.22 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  31.39 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.91 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  30.12 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  34.43 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468182  normal  0.167582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  31.72 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  33.97 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  35.51 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25400  Anti-sigma factor, FecR family  32.58 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  32.77 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  34.41 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  26.67 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  32.66 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  33.79 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2952  anti-FecI sigma factor, FecR  36.4 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  33.88 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>