115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2706 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  89.34 
 
 		 441 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  880    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  64.38 
 
 		 443 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  63.24 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  63.18 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  62.13 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  61 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  62.56 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  61.38 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  62.36 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  57.14 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  48.17 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  49.31 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  49.31 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  49.31 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  49.08 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  49.08 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  49.08 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  49.08 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  47.25 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  47.95 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  44.47 
 
 		 444 aa  328  9e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2559  hypothetical protein  44.93 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3720  hypothetical protein  38.76 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  40.64 
 
 		 447 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4162  Zn-dependent protease  38.95 
 
 		 447 aa  289  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4122  putative Zn-dependent protease  38.72 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  32.58 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0754  hypothetical protein  38.74 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.1 
 
 		 443 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.33 
 
 		 444 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.49 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.2 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.42 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.28 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.7 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.06 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.57 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.75 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  28.52 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.82 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.65 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0062  Zn-dependent protease-like protein  24.78 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  26.92 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4551  pmbA protein  26.17 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0996  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  22.19 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.100891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  36.05 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.55 
 
 		 448 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  27.71 
 
 		 478 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  28.22 
 
 		 457 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  26.13 
 
 		 457 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  37.5 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  37.68 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0313  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.76 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  28.8 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  27.56 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  27.32 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.25 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  28.89 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  28.89 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  27.05 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.29 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  29.45 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  32.1 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2382  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.92 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  30.99 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  27.98 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  28.44 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  26.4 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.08 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  30.99 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  27.27 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  20.41 
 
 		 448 aa  47.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2060  pmbA protein, putative  25 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.79 
 
 		 492 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  32.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  32.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  26.27 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  32.14 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09231  putative modulator of DNA gyrase  29.84 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.276659  hitchhiker  0.00000210119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  31.43 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  30.88 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.88 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  30.22 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  32.14 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.07 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.98 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  30.71 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  30.71 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  27.22 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>