More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3128 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3128  protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 268 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2587  non-specific protein-tyrosine kinase  99.63 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2727  non-specific protein-tyrosine kinase  96.27 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0484786  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2917  non-specific protein-tyrosine kinase  79.93 
 
 		 268 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.513725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1016  hypothetical protein  39.01 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.959397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4787  chromosome partitioning ATPase  32.14 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1447  chromosome partitioning ATPase  34.55 
 
 		 392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2579  non-specific protein-tyrosine kinase  32.75 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2583  tyrosine-protein kinase  33.64 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2406  chromosome partitioning ATPase  33.96 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2028  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.02 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.150521 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4240  chromosome partitioning ATPase protein-like  31.7 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.335949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0283  protein-tyrosine kinase  33.52 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2220  capsular exopolysaccharide family  36.31 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1983  polysaccharide biosynthesis protein, putative  32.45 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3389  chromosome partitioning ATPase  28.85 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2410  exopolysaccharide biosynthesis domain-containing protein  31.73 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.475738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  32.14 
 
 		 739 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  32.14 
 
 		 739 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  32.14 
 
 		 739 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0146  hypothetical protein  33.71 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  32.14 
 
 		 739 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.744329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2390  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.71 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2363  non-specific protein-tyrosine kinase  32.77 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1520  hypothetical protein  35.63 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00579805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  33.84 
 
 		 741 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.84 
 
 		 741 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 741 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.83 
 
 		 741 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  32.83 
 
 		 741 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  32.83 
 
 		 741 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1168  protein-tyrosine kinase  35.39 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.82 
 
 		 741 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2476  capsular exopolysaccharide family  32.75 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1771  exopolysaccharide/PEPCTERM locus tyrosine autokinase  32.16 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2473  polysaccharide biosynthesis protein, putative  31.36 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  32.57 
 
 		 464 aa  93.6  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0660  protein-tyrosine kinase  34.71 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0586  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.14 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898797 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.46 
 
 		 730 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02601  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  31.98 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  31.98 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5027  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.99 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3507  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  32.75 
 
 		 305 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000503243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  29.72 
 
 		 443 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  29.72 
 
 		 497 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.02 
 
 		 780 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1926  protein-tyrosine kinase  26.52 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3119  chromosome partitioning ATPase protein-like  30.36 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3280  protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.21 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  32.98 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  30.3 
 
 		 733 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  33.16 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.64 
 
 		 730 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  35.09 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  30.48 
 
 		 781 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2334  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  30.69 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.018256  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.64 
 
 		 474 aa  82.8  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.98 
 
 		 667 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2399  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  31.78 
 
 		 490 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  31.87 
 
 		 782 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 524 aa  82.4  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  28.74 
 
 		 767 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  32.63 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.52 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.47 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  30.69 
 
 		 496 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  31.02 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  30.21 
 
 		 722 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1983  protein-tyrosine kinase  33.72 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1420  capsular exopolysaccharide family  31.52 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3069  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.3 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  30.06 
 
 		 802 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  31.21 
 
 		 790 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  33.16 
 
 		 753 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2527  capsular polysaccharide biosynthesis-like protein  31.33 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  28.14 
 
 		 732 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.05 
 
 		 492 aa  79.3  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.91 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0832  protein-tyrosine kinase  27.06 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.63 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  28.14 
 
 		 740 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  31.28 
 
 		 746 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  31.16 
 
 		 737 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  31.32 
 
 		 741 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  30.51 
 
 		 780 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33.51 
 
 		 726 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>