More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0535 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0580  TonB-dependent siderophore receptor  97.38 
 
 		 725 aa  1442    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0535  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 725 aa  1478    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2539  TonB-dependent siderophore receptor  50.55 
 
 		 719 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0586  TonB-dependent siderophore receptor  92.69 
 
 		 724 aa  1382    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0569  TonB-dependent siderophore receptor  98.48 
 
 		 724 aa  1458    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4217  outer membrane ferripyoverdine receptor  33.29 
 
 		 812 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0874  TonB-dependent siderophore receptor  34.4 
 
 		 840 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.708566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09970  type I ferripyoverdine receptor, FpvB  32.78 
 
 		 802 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  32.97 
 
 		 722 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3280  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 802 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.118195  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 825 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1784  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 717 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306565  normal  0.0192687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4481  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 824 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207643  normal  0.919252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33680  ferripyoverdine receptor  31.82 
 
 		 815 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.133234  normal  0.0177724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0669  outer membrane ferric siderophore receptor  30.93 
 
 		 810 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.907614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 817 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 		 828 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4640  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 719 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0269226  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 819 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 724 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0759  TonB-dependent siderophore receptor  31.91 
 
 		 800 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0846  TonB-dependent siderophore receptor  32.25 
 
 		 841 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 828 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1834  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 		 787 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0450384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3692  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 722 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1879  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 841 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 738 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3273  TonB-dependent siderophore receptor  32.26 
 
 		 826 aa  309  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480033  normal  0.0611881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1303  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0879  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.34 
 
 		 713 aa  308  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.871457  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0860  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 841 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40210  second ferripyoverdine receptor  31.53 
 
 		 799 aa  306  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 745 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09340  Fe(III)-pyochelin outer membrane receptor precursor  31.15 
 
 		 720 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25550  TonB-dependent siderophore receptor/ferripyoverdine receptor  31.6 
 
 		 807 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1823  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  29.97 
 
 		 747 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3544  TonB-dependent siderophore receptor  31.75 
 
 		 844 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40910  ferripyoverdine receptor  30.81 
 
 		 808 aa  300  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00205881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  31.29 
 
 		 812 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0845  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 703 aa  299  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 		 803 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17690  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 806 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21530  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 795 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3328  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 822 aa  298  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.513174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 830 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0604  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 831 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 809 aa  295  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0793  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  29.67 
 
 		 719 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.454561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0883  TonB-dependepnt Fe(III)-pyochelin receptor  29.67 
 
 		 719 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2155  Fe(III)-pyochelin receptor precursor  29.67 
 
 		 752 aa  294  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44970  TonB-dependent siderophore receptor  31.18 
 
 		 798 aa  293  8e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1961  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 803 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281016  normal  0.90568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1440  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 827 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2151  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.24 
 
 		 825 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0848793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 814 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4418  ferripyoverdine receptor  31.27 
 
 		 766 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2152  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.2 
 
 		 743 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1848  TonB-dependent siderophore receptor  30.29 
 
 		 826 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.817483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1962  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 746 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3317  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 816 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1055  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  29.32 
 
 		 747 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1732  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 864 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0884061  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2016  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 821 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1449  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 822 aa  273  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0400  ferripyoverdine receptor  27.16 
 
 		 744 aa  273  9e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.736403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1617  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  30.33 
 
 		 728 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000544721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1481  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.48 
 
 		 729 aa  270  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00382185  hitchhiker  0.00000310394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1223  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.48 
 
 		 729 aa  270  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000020204  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3182  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 735 aa  270  8.999999999999999e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01098  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.48 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.523255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2499  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.48 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318087  unclonable  0.0000000283448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1224  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.48 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000059752  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01106  hypothetical protein  27.48 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.689576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2545  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 729 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00327648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  28.39 
 
 		 789 aa  268  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2222  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.21 
 
 		 729 aa  267  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2165  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000331924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  29.36 
 
 		 731 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1981  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0489607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1318  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.98 
 
 		 724 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45545  hitchhiker  0.0000000229507 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3601  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 836 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.743224  normal  0.189186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1171  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.963652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1303  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.84 
 
 		 724 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11921  hitchhiker  0.00000000921463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2025  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.35 
 
 		 729 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000237263  hitchhiker  0.0000045764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 729 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  30.23 
 
 		 722 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 765 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1280  ferric-rhodotorulic acid outer membrane transporter  27.84 
 
 		 724 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.76264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2049  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 833 aa  259  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 765 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3410  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 714 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 722 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 733 aa  258  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0298  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 765 aa  257  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5131  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 841 aa  256  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.112839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  30.32 
 
 		 722 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0692  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 801 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>