More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63551 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  100 
 
 
522 aa  1081    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  47.4 
 
 
574 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  43.37 
 
 
564 aa  445  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  34.29 
 
 
1163 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.62 
 
 
696 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.01 
 
 
1652 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  35.4 
 
 
947 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.38 
 
 
1363 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  37.54 
 
 
1236 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  35.15 
 
 
1523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.2 
 
 
1240 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.72 
 
 
1481 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.92 
 
 
1557 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  34.8 
 
 
1364 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  32.76 
 
 
1552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.3 
 
 
1247 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  32.29 
 
 
1553 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.44 
 
 
676 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  32.69 
 
 
1474 aa  173  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  34.12 
 
 
1510 aa  173  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  32.37 
 
 
1454 aa  170  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.08 
 
 
1188 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.69 
 
 
682 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 
1196 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  33.13 
 
 
1599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
1367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.54 
 
 
919 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.66 
 
 
1357 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.62 
 
 
1267 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  31.12 
 
 
1789 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.17 
 
 
677 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.01 
 
 
1213 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  29.92 
 
 
1221 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.46 
 
 
1443 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  32.51 
 
 
344 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.83 
 
 
1547 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.81 
 
 
642 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.9 
 
 
1686 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  34.15 
 
 
1656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.64 
 
 
1626 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  36.27 
 
 
657 aa  156  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.43 
 
 
1868 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.83 
 
 
1262 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  31.56 
 
 
1161 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  31.56 
 
 
1161 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.75 
 
 
1190 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  34.87 
 
 
1416 aa  153  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 
576 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.29 
 
 
630 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.69 
 
 
664 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  32.1 
 
 
434 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.48 
 
 
344 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  31.6 
 
 
778 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.31 
 
 
1609 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32 
 
 
692 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  31.38 
 
 
1229 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.29 
 
 
1760 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.86 
 
 
740 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.98 
 
 
774 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 
1193 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.11 
 
 
1858 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.9 
 
 
792 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.23 
 
 
1398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  33.84 
 
 
742 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  31.09 
 
 
1188 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.65 
 
 
930 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.67 
 
 
1211 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  34.36 
 
 
1214 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.03 
 
 
1583 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  31.68 
 
 
1878 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.5 
 
 
1711 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  31.08 
 
 
335 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.91 
 
 
675 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.52 
 
 
1607 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  33.13 
 
 
1217 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  34.81 
 
 
1411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  31.52 
 
 
1661 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.99 
 
 
1599 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.19 
 
 
1598 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.48 
 
 
505 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.43 
 
 
1831 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  27.97 
 
 
589 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 
1714 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31.4 
 
 
316 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.54 
 
 
1208 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.71 
 
 
1901 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.83 
 
 
1242 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  31.25 
 
 
316 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.04 
 
 
716 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  31.67 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.94 
 
 
608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  32.06 
 
 
522 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  32.07 
 
 
316 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  33.08 
 
 
443 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.75 
 
 
737 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  31.9 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.35 
 
 
596 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
577 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  29.6 
 
 
728 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>