More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_31786 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_31786  peroxisomal assembly protein  100 
 
 
1178 aa  2389    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02925  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 6 (Eurofung)  36.88 
 
 
1476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.637827  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03110  hypothetical protein  41.84 
 
 
1124 aa  522  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.86 
 
 
718 aa  281  5e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.98 
 
 
810 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  35.95 
 
 
814 aa  275  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46568  predicted protein  43.7 
 
 
821 aa  270  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.927409  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.53 
 
 
723 aa  266  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  35.41 
 
 
804 aa  265  4.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.1 
 
 
768 aa  264  8e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  32.57 
 
 
829 aa  263  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.38 
 
 
759 aa  262  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.32 
 
 
736 aa  260  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32 
 
 
754 aa  260  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.1 
 
 
769 aa  259  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.31 
 
 
754 aa  259  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.24 
 
 
754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.63 
 
 
727 aa  255  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.47 
 
 
732 aa  255  3e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.87 
 
 
738 aa  254  5.000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  31.59 
 
 
754 aa  254  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.14 
 
 
735 aa  253  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.45 
 
 
781 aa  253  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.07 
 
 
739 aa  253  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  31.25 
 
 
550 aa  253  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 
760 aa  253  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.68 
 
 
719 aa  252  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.09 
 
 
742 aa  250  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.19 
 
 
737 aa  249  2e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.08 
 
 
737 aa  248  6e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  33.2 
 
 
806 aa  247  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.08 
 
 
781 aa  247  9e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.9 
 
 
738 aa  247  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.51 
 
 
784 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.91 
 
 
757 aa  246  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.39 
 
 
742 aa  244  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.91 
 
 
800 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.67 
 
 
808 aa  243  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.82 
 
 
731 aa  243  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  34.15 
 
 
722 aa  243  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.28 
 
 
743 aa  243  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.62 
 
 
731 aa  243  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.67 
 
 
732 aa  243  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.72 
 
 
721 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  32.58 
 
 
729 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.23 
 
 
736 aa  241  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.58 
 
 
763 aa  241  5e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.2 
 
 
806 aa  241  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.26 
 
 
740 aa  241  8e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  29.83 
 
 
756 aa  240  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.58 
 
 
738 aa  240  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  30 
 
 
930 aa  240  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  33.54 
 
 
713 aa  240  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.82 
 
 
731 aa  239  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.27 
 
 
773 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.94 
 
 
740 aa  239  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83848  AAA ATPase, peroxisomal biogenesis  39.66 
 
 
1053 aa  238  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  29.73 
 
 
775 aa  238  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.21 
 
 
757 aa  238  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.04 
 
 
731 aa  238  7e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.11 
 
 
757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  33.2 
 
 
764 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.78 
 
 
754 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.3 
 
 
755 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.74 
 
 
704 aa  236  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.22 
 
 
709 aa  235  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  30.87 
 
 
691 aa  234  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.84 
 
 
772 aa  234  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  32.65 
 
 
613 aa  234  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  30.8 
 
 
763 aa  232  3e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.63 
 
 
852 aa  232  4e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  32.16 
 
 
552 aa  230  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.86 
 
 
756 aa  230  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  33.4 
 
 
721 aa  229  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.8 
 
 
701 aa  228  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.2 
 
 
801 aa  228  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.25 
 
 
805 aa  227  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06230  conserved hypothetical protein  34 
 
 
1076 aa  227  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  32.19 
 
 
703 aa  226  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.05 
 
 
715 aa  226  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.79 
 
 
805 aa  225  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.94 
 
 
753 aa  225  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  32.32 
 
 
803 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  29.5 
 
 
810 aa  224  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  32.16 
 
 
639 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  31.66 
 
 
718 aa  221  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  31.79 
 
 
685 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36081  predicted protein  41.67 
 
 
366 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  32.67 
 
 
601 aa  218  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05991  peroxisome biogenesis protein peroxin 1 (Eurofung)  40.55 
 
 
1225 aa  218  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.53 
 
 
804 aa  217  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  32.74 
 
 
567 aa  217  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.25 
 
 
810 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  40.26 
 
 
832 aa  215  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  30.2 
 
 
749 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.53 
 
 
801 aa  213  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.55 
 
 
703 aa  213  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  31.41 
 
 
746 aa  209  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.27 
 
 
730 aa  208  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  31.03 
 
 
647 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>