More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47619 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  100 
 
 		 1565 aa  3252    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  37.17 
 
 		 1528 aa  357  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  36.66 
 
 		 971 aa  356  2e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  37.89 
 
 		 551 aa  343  1e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  32.83 
 
 		 941 aa  311  6.999999999999999e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  33.64 
 
 		 750 aa  241  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  33.79 
 
 		 836 aa  240  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  30.92 
 
 		 749 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  30.95 
 
 		 851 aa  229  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 		 756 aa  228  9e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.51 
 
 		 820 aa  225  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  33.53 
 
 		 763 aa  224  8e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  30.78 
 
 		 769 aa  220  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  31.72 
 
 		 829 aa  217  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  30.68 
 
 		 833 aa  211  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  30.74 
 
 		 749 aa  211  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  30.74 
 
 		 745 aa  209  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  32.21 
 
 		 751 aa  208  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  30.96 
 
 		 751 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  31.24 
 
 		 754 aa  205  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  30.45 
 
 		 749 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  30.75 
 
 		 776 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 502 aa  184  9.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  33.2 
 
 		 938 aa  138  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  35.35 
 
 		 808 aa  127  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02300  Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, putative  37.63 
 
 		 1064 aa  73.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.890789  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06675  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05250)  33.7 
 
 		 1173 aa  66.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0408152 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8266  predicted protein  35.96 
 
 		 146 aa  62.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.42 
 
 		 538 aa  62  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29003  predicted protein  29.52 
 
 		 831 aa  61.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.596418  normal  0.417698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.87 
 
 		 581 aa  61.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.35 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16230  excinuclease ABC, B subunit  30 
 
 		 672 aa  60.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  29.45 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3227  predicted protein  28.95 
 
 		 416 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0464388  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  34.78 
 
 		 822 aa  57.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.56 
 
 		 545 aa  58.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  33.33 
 
 		 1043 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.25 
 
 		 712 aa  57.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  38.64 
 
 		 434 aa  57.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.68 
 
 		 669 aa  57.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2685  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 		 343 aa  57  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.22 
 
 		 1187 aa  57  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2971  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.15 
 
 		 444 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2855  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.15 
 
 		 444 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0723995  normal  0.849039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2858  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.15 
 
 		 444 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.197769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2837  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.15 
 
 		 444 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2753  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.15 
 
 		 444 aa  57  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.902304  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.66 
 
 		 359 aa  56.2  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.952507 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  31.52 
 
 		 583 aa  56.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 		 425 aa  56.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1059  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.88 
 
 		 450 aa  56.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0187648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 		 556 aa  56.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  40.45 
 
 		 667 aa  55.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.17 
 
 		 589 aa  55.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  30.36 
 
 		 585 aa  55.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0773  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 		 502 aa  55.5  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.463701 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  38.55 
 
 		 583 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.67 
 
 		 584 aa  54.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl525  ATP-dependent RNA helicase  33.03 
 
 		 666 aa  54.7  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1114  predicted protein  30.53 
 
 		 478 aa  55.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0466739  normal  0.893767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1437  DEAD/DEAH box helicase-like  27.46 
 
 		 446 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.07 
 
 		 657 aa  54.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22900  DNA/RNA helicase, superfamily II  38.55 
 
 		 657 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.11 
 
 		 506 aa  54.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000532471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.3 
 
 		 614 aa  54.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 527 aa  54.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1195  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.4 
 
 		 441 aa  54.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000749506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.67 
 
 		 491 aa  54.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  29.13 
 
 		 421 aa  54.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  38.82 
 
 		 656 aa  54.7  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0950  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.31 
 
 		 432 aa  53.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  30.91 
 
 		 583 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3063  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.79 
 
 		 442 aa  54.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.124776  decreased coverage  0.0000384662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19290  putative ATP-dependent RNA helicase  29.6 
 
 		 446 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2118  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.11 
 
 		 506 aa  54.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000739492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2794  ATP-dependent RNA helicase SrmB  29.03 
 
 		 446 aa  53.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3080  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.4 
 
 		 441 aa  53.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  35.58 
 
 		 662 aa  54.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  29.76 
 
 		 586 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1011  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.98 
 
 		 453 aa  53.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.71 
 
 		 451 aa  53.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  29.76 
 
 		 586 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40593  Dead-Box Protein 8, ATP-dependent helicase involved in rRNA processing  38.36 
 
 		 445 aa  53.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 1013 aa  53.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  27.85 
 
 		 459 aa  53.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.93 
 
 		 643 aa  53.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 586 aa  53.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.5 
 
 		 590 aa  53.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0211  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.61 
 
 		 383 aa  53.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  29.76 
 
 		 586 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04903  ATP-dependent RNA helicase dbp8 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B3H7]  40.85 
 
 		 525 aa  53.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1101  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.97 
 
 		 444 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.97 
 
 		 487 aa  53.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2729  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.97 
 
 		 444 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0618192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>