More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14845 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14845  predicted protein  100 
 
 		 440 aa  926    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00110  ATP-dependent DNA helicase, putative  44.92 
 
 		 876 aa  310  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368414  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02087  Putative uncharacterized proteinRecQ helicase MUSN ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P8H3]  38.94 
 
 		 1534 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33966  predicted protein  40.52 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210116  normal  0.28032 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47969  ATP-dependent DNA helicase  35.73 
 
 		 1148 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38991  predicted protein  43.84 
 
 		 466 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0505121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.02 
 
 		 606 aa  274  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  36.96 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.53 
 
 		 729 aa  266  5e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.87 
 
 		 626 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 607 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 607 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 607 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 		 607 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.48 
 
 		 719 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 		 607 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 		 607 aa  262  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 		 607 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.32 
 
 		 618 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.94 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 		 659 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.5 
 
 		 610 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.51 
 
 		 613 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 		 611 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 		 625 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.9 
 
 		 596 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.6 
 
 		 599 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 725 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.67 
 
 		 620 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 		 731 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.94 
 
 		 607 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.21 
 
 		 636 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 		 611 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 		 611 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.06 
 
 		 623 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 		 637 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.33 
 
 		 599 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.53 
 
 		 731 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.34 
 
 		 709 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.62 
 
 		 709 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 		 615 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.86 
 
 		 733 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.38 
 
 		 611 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.66 
 
 		 715 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  38.08 
 
 		 637 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.23 
 
 		 633 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.89 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.58 
 
 		 709 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.59 
 
 		 677 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.83 
 
 		 623 aa  253  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 		 609 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 		 625 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 		 615 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.42 
 
 		 633 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.72 
 
 		 737 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.27 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 		 639 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  36.43 
 
 		 734 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.15 
 
 		 714 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.35 
 
 		 615 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 		 610 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.32 
 
 		 610 aa  250  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.01 
 
 		 601 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 		 710 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.19 
 
 		 657 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.07 
 
 		 736 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.16 
 
 		 729 aa  250  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.28 
 
 		 622 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.28 
 
 		 624 aa  249  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 709 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.84 
 
 		 619 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 615 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 615 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 615 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 		 608 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 615 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.02 
 
 		 602 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.91 
 
 		 607 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 763 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.95 
 
 		 644 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 		 615 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 		 599 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.89 
 
 		 617 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.65 
 
 		 630 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.84 
 
 		 711 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.27 
 
 		 712 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 		 705 aa  247  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 		 607 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.74 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 709 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.02 
 
 		 601 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 		 707 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.14 
 
 		 611 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 		 615 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>