64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1215 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1215  lipoprotein protein, putative  100 
 
 		 270 aa  549  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1145  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.89 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6968  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.71 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.167496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1307  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.27 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1196  hypothetical protein  31.46 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5214  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.35 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3017  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1502  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.78 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3469  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.07 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09443  lipoprotein protein, putative  31.25 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0679  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.86 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.755098  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2489  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.318868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.15 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.896668  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  20.47 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  28.43 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  25.88 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.9 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  33.04 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.45 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  28.69 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  24.18 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  27.69 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  26.21 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  27.69 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  23.12 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  21.96 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  24.76 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  24.72 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1148  putative lipoprotein  26.59 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  23.5 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1021  putative lipoprotein  23.67 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000015232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 266 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  28.46 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  20 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3712  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  23.18 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  20.82 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.87 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3172  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000327515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0985  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.36 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.233637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  22.75 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.23 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3273  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000016984  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1085  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1016  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1118  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000738911  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2994  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000158327  normal  0.33203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2881  putative lipoprotein  25 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449553  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3075  putative lipoprotein  24.15 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000146144  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.41 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3580  hypothetical protein  24.15 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  24.71 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  25 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.33 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  23.33 
 
 		 262 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>