285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4188 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  69.67 
 
 		 239 aa  323  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  69.19 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  68.9 
 
 		 227 aa  303  9.000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  69.65 
 
 		 202 aa  297  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  65.4 
 
 		 221 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  63.93 
 
 		 230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  61.24 
 
 		 233 aa  272  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  46.94 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  47.69 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  49.23 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  50 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  44.78 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  45.45 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  43.43 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1130  lipoate-protein ligase B  44.91 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0209414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  45.59 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  40.17 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  40.69 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  45.15 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  41.05 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  41.13 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  54.78 
 
 		 157 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  43.38 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  45.92 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  40.69 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  43.63 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2547  lipoate-protein ligase B  45.89 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.621544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  39.57 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  37.28 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1043  lipoate-protein ligase B  43.06 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.69675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  48.33 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  48.21 
 
 		 167 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.06 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  40.11 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  43.78 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  41.3 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4305  lipoate-protein ligase B  41.31 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3366  lipoate-protein ligase B  40.28 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  38.69 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.91 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  37.04 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12245  lipoate-protein ligase B  45.55 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155606  normal  0.410029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  38.5 
 
 		 383 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1515  lipoate-protein ligase B  38.89 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  43.01 
 
 		 247 aa  144  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0927  lipoate-protein ligase B  43.75 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.257939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_002950  PG1343  lipoate-protein ligase B  39.63 
 
 		 492 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  41.21 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1921  lipoate-protein ligase B  43.72 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00431373  hitchhiker  0.000603896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  44.19 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  45.03 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  43.6 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3326  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3315  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3377  lipoate-protein ligase B  40 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  43.6 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 365 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3076  lipoate-protein ligase B  42.08 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0986456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  39.79 
 
 		 365 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 365 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  37.81 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3581  lipoate-protein ligase B  42.71 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460285  normal  0.0785482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0700  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.248004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  45.71 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2933  lipoate-protein ligase B  44.15 
 
 		 238 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1775  lipoate-protein ligase B  45.41 
 
 		 277 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1859  lipoate-protein ligase B  39.62 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 244 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2300  lipoate-protein ligase B  42.19 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 267 aa  137  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  41.67 
 
 		 211 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  41.44 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  41.78 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  39.05 
 
 		 267 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  43.98 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1675  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  44.57 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4888  lipoate-protein ligase B  37.76 
 
 		 213 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1267  lipoate-protein ligase B  38.29 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118424  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  39.9 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0992  lipoyltransferase  42.16 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0378956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2641  Lipoyl(octanoyl) transferase  37.17 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3284  lipoate-protein ligase B  44.39 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.544792  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  41.81 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1015  lipoate-protein ligase B  42.51 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  38.16 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1756  lipoate-protein ligase B  36.45 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  38.86 
 
 		 535 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0940  lipoate-protein ligase B  38.24 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0737269  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  36.67 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  37.26 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>