More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3926 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
340 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  56.73 
 
 
347 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  56.93 
 
 
344 aa  361  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  55.85 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2670  protein of unknown function UPF0118  54.78 
 
 
345 aa  322  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3434  protein of unknown function UPF0118  54.78 
 
 
345 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  51.47 
 
 
379 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  50.3 
 
 
372 aa  309  5.9999999999999995e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  51.62 
 
 
336 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  42.44 
 
 
349 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  47.41 
 
 
387 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  46.33 
 
 
344 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  46.33 
 
 
344 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  39.67 
 
 
359 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5210  protein of unknown function UPF0118  44.9 
 
 
345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  39.03 
 
 
358 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  38.18 
 
 
358 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  39.41 
 
 
360 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0581  protein of unknown function UPF0118  49.23 
 
 
357 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  41.77 
 
 
359 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  34.5 
 
 
347 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  33.53 
 
 
347 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  34.5 
 
 
347 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1274  hypothetical protein  41.19 
 
 
359 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.094175  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  34.58 
 
 
333 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  30.86 
 
 
356 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  30.82 
 
 
329 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 
372 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  30.08 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.7 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  31.3 
 
 
346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  31.3 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.03 
 
 
341 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  28.29 
 
 
349 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  29.62 
 
 
424 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1113  hypothetical protein  28.36 
 
 
363 aa  106  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0939063  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 
529 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  28.62 
 
 
340 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 
364 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  28.31 
 
 
340 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 
354 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  24.76 
 
 
381 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 
376 aa  100  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  28.74 
 
 
435 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  26.84 
 
 
443 aa  99.4  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  28.4 
 
 
340 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 
388 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  28.02 
 
 
351 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.32 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.32 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.32 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  30.22 
 
 
370 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.32 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  24.61 
 
 
423 aa  94  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.54 
 
 
357 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 
383 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.32 
 
 
373 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  25.14 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.32 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.32 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.32 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.86 
 
 
361 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.32 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  26.65 
 
 
404 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  25.99 
 
 
371 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.17 
 
 
361 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  32.79 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  30.25 
 
 
343 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  26 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  23.99 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  28.33 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 
417 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  25.07 
 
 
387 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  31.55 
 
 
401 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  31.55 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.68 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  27.13 
 
 
436 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  27.33 
 
 
388 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2750  hypothetical protein  28.79 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  25.44 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  23.61 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  25.38 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  28.81 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  29.36 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.19 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  22.87 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  22.43 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  27.54 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  24.22 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.22 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>