129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2260 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2260  group II decarboxylase family protein  100 
 
 		 775 aa  1605    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0093  group II decarboxylase family protein  44.31 
 
 		 731 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0951  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.19 
 
 		 1193 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0404073  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  33.15 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.88 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0782914 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.49 
 
 		 560 aa  100  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  24.84 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  24.16 
 
 		 533 aa  95.9  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.2 
 
 		 549 aa  94  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.93 
 
 		 546 aa  93.2  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.32 
 
 		 550 aa  93.2  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  25 
 
 		 549 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.8 
 
 		 549 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.39 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.33 
 
 		 549 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.16 
 
 		 554 aa  89.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.32 
 
 		 549 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.17 
 
 		 549 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.33 
 
 		 549 aa  89.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  28.19 
 
 		 548 aa  88.2  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 		 552 aa  87.8  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.67 
 
 		 548 aa  87.8  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.33 
 
 		 551 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.11 
 
 		 549 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.16 
 
 		 552 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.09 
 
 		 573 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.58 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  27.23 
 
 		 548 aa  80.5  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  37.01 
 
 		 475 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  26.81 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.91 
 
 		 550 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  22.96 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.91 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.83 
 
 		 567 aa  77  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  28.44 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  33.16 
 
 		 472 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.99 
 
 		 490 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.44 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.76 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.91 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  22.06 
 
 		 461 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.04 
 
 		 789 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.87 
 
 		 505 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  27.83 
 
 		 544 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.15 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.26 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.26 
 
 		 530 aa  64.7  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.04 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.32 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.46 
 
 		 574 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  27.18 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.05 
 
 		 515 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.31 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.69 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.69 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.41 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.06 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.19 
 
 		 551 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.12 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  27.71 
 
 		 369 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.32 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.13 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  27.64 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.32 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.69 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5487  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.46 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108585 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  26.63 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.59 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.85 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.04 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  24.73 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  27.03 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  28.08 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.59 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2806  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  25.91 
 
 		 560 aa  57  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  27.27 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  27.34 
 
 		 390 aa  57  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.29 
 
 		 494 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.09 
 
 		 529 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  23.4 
 
 		 967 aa  56.6  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  27.13 
 
 		 511 aa  55.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  26.11 
 
 		 384 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.17 
 
 		 470 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.35 
 
 		 529 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.21 
 
 		 507 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.96 
 
 		 530 aa  54.7  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  25.12 
 
 		 384 aa  54.7  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.13 
 
 		 456 aa  54.7  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30 
 
 		 374 aa  54.3  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  25.68 
 
 		 456 aa  54.3  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.41 
 
 		 361 aa  54.3  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  25.62 
 
 		 384 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  24.88 
 
 		 349 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  22.98 
 
 		 517 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.51 
 
 		 479 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  24.39 
 
 		 349 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.33 
 
 		 484 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  25.52 
 
 		 484 aa  52  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.04 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>