245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0144 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  100 
 
 
456 aa  931    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  98.9 
 
 
456 aa  920    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  57.14 
 
 
470 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10231  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  58.68 
 
 
455 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.1178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.19 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1209  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.1 
 
 
469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  51.45 
 
 
461 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  49.89 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  50 
 
 
461 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  49.89 
 
 
460 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  34.27 
 
 
489 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.32 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.33 
 
 
511 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.65 
 
 
517 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  33.06 
 
 
577 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.79 
 
 
484 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.42 
 
 
530 aa  167  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  31.5 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.85 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.85 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.85 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.44 
 
 
551 aa  163  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.78 
 
 
508 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.87 
 
 
522 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
530 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.04 
 
 
507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  31.64 
 
 
453 aa  156  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.84 
 
 
480 aa  156  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.63 
 
 
529 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  28.95 
 
 
967 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.8 
 
 
529 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 
479 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.01 
 
 
510 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.42 
 
 
489 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.12 
 
 
490 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.5 
 
 
495 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.4 
 
 
515 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.54 
 
 
495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  29.3 
 
 
462 aa  153  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.7 
 
 
789 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.04 
 
 
466 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.11 
 
 
534 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.72 
 
 
474 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.12 
 
 
484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  24.09 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.35 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.59 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.74 
 
 
488 aa  146  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.83 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.45 
 
 
515 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  31.45 
 
 
515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  27.52 
 
 
507 aa  140  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  31.45 
 
 
515 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  29.94 
 
 
502 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.63 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.03 
 
 
490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.53 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.59 
 
 
511 aa  137  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.2 
 
 
492 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.28 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.31 
 
 
486 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.49 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  27.29 
 
 
548 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.41 
 
 
548 aa  130  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.94 
 
 
503 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  25.42 
 
 
961 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.75 
 
 
579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.65 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.73 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.7 
 
 
502 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.2 
 
 
480 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0743  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.88 
 
 
489 aa  126  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.18 
 
 
483 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  27.46 
 
 
548 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.53 
 
 
470 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.23 
 
 
560 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.97 
 
 
547 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.64 
 
 
527 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.25 
 
 
478 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.37 
 
 
486 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.24 
 
 
529 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  29.65 
 
 
958 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.74 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.82 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.03 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  32.68 
 
 
963 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.98 
 
 
470 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.93 
 
 
492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.03 
 
 
486 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.48 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.48 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.77 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.71 
 
 
554 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.67 
 
 
497 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  28.16 
 
 
474 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.37 
 
 
549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.77 
 
 
541 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.02 
 
 
475 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.53 
 
 
549 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.77 
 
 
549 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>