219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36228 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  100 
 
 
453 aa  942    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.68 
 
 
475 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  35.12 
 
 
507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  34.99 
 
 
577 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  34.01 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.01 
 
 
510 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  32.81 
 
 
515 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.74 
 
 
484 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.73 
 
 
547 aa  179  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.02 
 
 
530 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.47 
 
 
551 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.03 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.03 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.03 
 
 
484 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.85 
 
 
489 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.1 
 
 
511 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.74 
 
 
479 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  28.25 
 
 
548 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.77 
 
 
508 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  33 
 
 
491 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  27.21 
 
 
548 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.11 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.64 
 
 
456 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.71 
 
 
495 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.64 
 
 
456 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.22 
 
 
495 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.67 
 
 
466 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.71 
 
 
490 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.86 
 
 
488 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.24 
 
 
529 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.96 
 
 
489 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.85 
 
 
503 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.66 
 
 
479 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.75 
 
 
529 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  26.44 
 
 
548 aa  160  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.98 
 
 
483 aa  159  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  28.89 
 
 
511 aa  158  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.64 
 
 
502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  33.02 
 
 
474 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.58 
 
 
550 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.38 
 
 
517 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.62 
 
 
546 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.01 
 
 
544 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.12 
 
 
483 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.3 
 
 
505 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  32.74 
 
 
474 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.69 
 
 
488 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.95 
 
 
530 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.21 
 
 
484 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.88 
 
 
611 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.99 
 
 
474 aa  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.01 
 
 
471 aa  150  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.41 
 
 
515 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.87 
 
 
534 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  29.76 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.37 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  29.35 
 
 
967 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09421  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.77 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.45 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.65 
 
 
480 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  26.97 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  24.09 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.76 
 
 
546 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 
549 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.52 
 
 
573 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.32 
 
 
549 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.75 
 
 
515 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  30.35 
 
 
961 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.24 
 
 
549 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.56 
 
 
549 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.64 
 
 
549 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  25.11 
 
 
533 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0883  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  27.71 
 
 
461 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.354437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.37 
 
 
486 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.31 
 
 
548 aa  143  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.13 
 
 
479 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.45 
 
 
554 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.79 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.85 
 
 
484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10001  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.03 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.450995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.56 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.02 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.35 
 
 
574 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.11 
 
 
549 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.47 
 
 
560 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.52 
 
 
550 aa  140  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.13 
 
 
507 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  27.17 
 
 
552 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.52 
 
 
522 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1209  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.49 
 
 
469 aa  139  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.93 
 
 
475 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.01 
 
 
538 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.22 
 
 
551 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  29.33 
 
 
963 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.27 
 
 
536 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.65 
 
 
492 aa  134  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.53 
 
 
789 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.05 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  0.0000101933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.74 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.27 
 
 
480 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>