255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3584 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  62.8 
 
 
552 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  61.51 
 
 
543 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  59.34 
 
 
533 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  64.27 
 
 
550 aa  720    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  63.4 
 
 
548 aa  730    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  57.3 
 
 
550 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  61.75 
 
 
538 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.21 
 
 
554 aa  675    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  58.68 
 
 
549 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.06 
 
 
549 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.25 
 
 
549 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.96 
 
 
546 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.68 
 
 
549 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  60.11 
 
 
547 aa  709    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.25 
 
 
549 aa  675    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  61.21 
 
 
567 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.85 
 
 
560 aa  661    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
611 aa  1273    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  63.45 
 
 
548 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  58 
 
 
549 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.68 
 
 
549 aa  669    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.85 
 
 
548 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.87 
 
 
549 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  57.54 
 
 
551 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  62.45 
 
 
548 aa  714    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.58 
 
 
546 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  57.64 
 
 
536 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  56.98 
 
 
544 aa  581  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  55.74 
 
 
552 aa  535  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  54.66 
 
 
552 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.56 
 
 
541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  45.9 
 
 
573 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  43.74 
 
 
574 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  30.65 
 
 
484 aa  187  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.66 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.53 
 
 
490 aa  174  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.4 
 
 
551 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  30.07 
 
 
489 aa  170  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 
530 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.08 
 
 
495 aa  167  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.81 
 
 
489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.13 
 
 
508 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.86 
 
 
495 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.42 
 
 
517 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  27.67 
 
 
522 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.44 
 
 
529 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.79 
 
 
488 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.66 
 
 
789 aa  160  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.15 
 
 
511 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.13 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.94 
 
 
507 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.69 
 
 
515 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28 
 
 
503 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.98 
 
 
505 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.06 
 
 
483 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  27.25 
 
 
515 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.03 
 
 
515 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.68 
 
 
484 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.72 
 
 
510 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.79 
 
 
544 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  24.07 
 
 
967 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.53 
 
 
527 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  27.65 
 
 
453 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.1 
 
 
529 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.05 
 
 
494 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.53 
 
 
484 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.53 
 
 
484 aa  143  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.53 
 
 
484 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.93 
 
 
529 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.53 
 
 
484 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.29 
 
 
483 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.72 
 
 
534 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.97 
 
 
515 aa  140  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.59 
 
 
502 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.65 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.57 
 
 
475 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  26.06 
 
 
507 aa  137  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.41 
 
 
477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  25.68 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1051  hypothetical protein  24.78 
 
 
636 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.922424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.97 
 
 
480 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  29.05 
 
 
462 aa  127  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  26.37 
 
 
577 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.89 
 
 
488 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  27.54 
 
 
502 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  29.81 
 
 
491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.71 
 
 
458 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  24.82 
 
 
496 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  24.23 
 
 
963 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.02 
 
 
517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.06 
 
 
492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  30 
 
 
474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  31.84 
 
 
474 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.43 
 
 
486 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  24.67 
 
 
958 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.35 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  25.36 
 
 
961 aa  114  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.23 
 
 
475 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.12 
 
 
479 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0304  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.78 
 
 
581 aa  113  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0782914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>