259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0285 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
529 aa  1061    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  79.42 
 
 
544 aa  785    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  59.13 
 
 
508 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  58.73 
 
 
511 aa  536  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  54.28 
 
 
551 aa  509  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  50.39 
 
 
530 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  49.4 
 
 
515 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  49.4 
 
 
515 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  53.2 
 
 
530 aa  489  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  49 
 
 
515 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  50.31 
 
 
484 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  53.92 
 
 
534 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  45.57 
 
 
515 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  46.28 
 
 
505 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.47 
 
 
507 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  50.2 
 
 
484 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  49.7 
 
 
529 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.43 
 
 
522 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.28 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  40.17 
 
 
961 aa  342  7e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.13 
 
 
503 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.23 
 
 
488 aa  336  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.62 
 
 
495 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  39.91 
 
 
963 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.76 
 
 
488 aa  329  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.2 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.52 
 
 
490 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.58 
 
 
967 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  38.83 
 
 
958 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  40.22 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  37.04 
 
 
511 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.88 
 
 
789 aa  266  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.54 
 
 
484 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.72 
 
 
475 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.83 
 
 
502 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.27 
 
 
554 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.17 
 
 
517 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  35.06 
 
 
502 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  34.82 
 
 
489 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.62 
 
 
479 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.29 
 
 
529 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.05 
 
 
479 aa  193  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.22 
 
 
486 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.11 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.92 
 
 
480 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.12 
 
 
466 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.55 
 
 
484 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.51 
 
 
510 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.7 
 
 
492 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.77 
 
 
486 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.29 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.02 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.29 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  33.96 
 
 
483 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.83 
 
 
549 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.76 
 
 
497 aa  178  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.55 
 
 
549 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.27 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.27 
 
 
549 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.4 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.24 
 
 
486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.84 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.51 
 
 
554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.5 
 
 
484 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  31.55 
 
 
491 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.99 
 
 
549 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.45 
 
 
552 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.15 
 
 
476 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.76 
 
 
546 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.75 
 
 
486 aa  170  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.14 
 
 
549 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.14 
 
 
549 aa  170  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  28.64 
 
 
548 aa  169  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.14 
 
 
549 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.67 
 
 
573 aa  169  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.6 
 
 
496 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6749  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.32 
 
 
574 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.88 
 
 
547 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.68 
 
 
550 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  29.93 
 
 
462 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  28.98 
 
 
548 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.52 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  28.85 
 
 
533 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.86 
 
 
560 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.98 
 
 
551 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.44 
 
 
611 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  29.68 
 
 
552 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.67 
 
 
477 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.86 
 
 
470 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.16 
 
 
567 aa  159  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.13 
 
 
489 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.91 
 
 
548 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  29.31 
 
 
456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  33.25 
 
 
492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.42 
 
 
458 aa  157  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  34.22 
 
 
456 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.5 
 
 
480 aa  153  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.36 
 
 
550 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  25.76 
 
 
479 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  33.24 
 
 
453 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>