276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1074 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
551 aa  1101    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  64.23 
 
 
508 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  63.6 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  62.92 
 
 
530 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  59.49 
 
 
534 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  54.28 
 
 
529 aa  514  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  49.79 
 
 
515 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  50 
 
 
515 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  55.69 
 
 
544 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  49.58 
 
 
515 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  52.6 
 
 
530 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  49.33 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  45.57 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  42.68 
 
 
505 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.63 
 
 
484 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  44.68 
 
 
507 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.56 
 
 
529 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  41.65 
 
 
488 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  40.63 
 
 
488 aa  339  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.54 
 
 
511 aa  335  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  38.43 
 
 
961 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.79 
 
 
490 aa  326  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.86 
 
 
522 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  38.43 
 
 
963 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.24 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.67 
 
 
495 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  38.37 
 
 
958 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  36.77 
 
 
967 aa  321  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.01 
 
 
494 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  43.54 
 
 
503 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.13 
 
 
527 aa  312  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.3 
 
 
789 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.34 
 
 
502 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.89 
 
 
480 aa  217  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  37.65 
 
 
483 aa  217  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.15 
 
 
475 aa  216  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.42 
 
 
490 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.71 
 
 
484 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.88 
 
 
479 aa  206  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.3 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  31.95 
 
 
462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.6 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  34.87 
 
 
489 aa  193  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.74 
 
 
484 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.24 
 
 
466 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.63 
 
 
489 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.2 
 
 
484 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.2 
 
 
484 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.2 
 
 
484 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.07 
 
 
554 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.71 
 
 
529 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.33 
 
 
458 aa  188  3e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.33 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  32.75 
 
 
502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  29.15 
 
 
548 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.97 
 
 
573 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.21 
 
 
517 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.98 
 
 
470 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.43 
 
 
471 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.89 
 
 
483 aa  177  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.85 
 
 
536 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.22 
 
 
579 aa  177  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.48 
 
 
547 aa  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.73 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  29.42 
 
 
491 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.68 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  28.32 
 
 
548 aa  174  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.49 
 
 
611 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.76 
 
 
552 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.5 
 
 
492 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.57 
 
 
496 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.7 
 
 
510 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  28.74 
 
 
552 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.27 
 
 
546 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.27 
 
 
479 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.5 
 
 
497 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  35.47 
 
 
453 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.54 
 
 
538 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.33 
 
 
478 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.57 
 
 
474 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.08 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.88 
 
 
486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.84 
 
 
486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.94 
 
 
552 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.82 
 
 
554 aa  163  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  32.86 
 
 
474 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.1 
 
 
478 aa  163  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  0.0000101933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.9 
 
 
470 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.14 
 
 
560 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.26 
 
 
470 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.52 
 
 
548 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.44 
 
 
456 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  26.59 
 
 
543 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.54 
 
 
567 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09431  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  26.6 
 
 
461 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.2 
 
 
456 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.42 
 
 
486 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.95 
 
 
474 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  29 
 
 
577 aa  157  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.75 
 
 
492 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>