299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1055 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  100 
 
 
530 aa  1073    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  51.13 
 
 
515 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  50.93 
 
 
515 aa  530  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  50.93 
 
 
515 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0134  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  52.17 
 
 
515 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.83 
 
 
508 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  53.64 
 
 
511 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  50.39 
 
 
529 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  48.01 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  52.6 
 
 
551 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0512  Pyridoxal-dependent decarboxylase  51.72 
 
 
544 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  46.82 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  50.4 
 
 
534 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  46.25 
 
 
507 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  51.78 
 
 
530 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  47.06 
 
 
484 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2288  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.88 
 
 
494 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.715836  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42 
 
 
522 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1232  aminotransferase, class III/decarboxylase, group II  39.87 
 
 
961 aa  365  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000122861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  40.12 
 
 
488 aa  361  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  42.23 
 
 
488 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  49.21 
 
 
529 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2138  putative diaminobutyrate--2-oxoglutarate aminotransferase  38.22 
 
 
967 aa  352  8e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00227594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  40.3 
 
 
490 aa  350  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.72 
 
 
495 aa  345  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  39.71 
 
 
495 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02741  hypothetical protein  39.47 
 
 
963 aa  342  9e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  43.14 
 
 
503 aa  342  1e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0927  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  35.97 
 
 
511 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003101  diaminobutyrate-pyruvate transaminase/L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  37.24 
 
 
958 aa  333  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0214  Pyridoxal-dependent decarboxylase  38.56 
 
 
527 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.1 
 
 
789 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  35.04 
 
 
480 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  28.54 
 
 
479 aa  220  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2949  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.82 
 
 
502 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442662  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.05 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0661  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.43 
 
 
484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000151703  normal  0.871149 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  36.43 
 
 
489 aa  212  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  30.31 
 
 
491 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.55 
 
 
484 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.23 
 
 
490 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.38 
 
 
475 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.38 
 
 
529 aa  206  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.18 
 
 
486 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.74 
 
 
510 aa  203  7e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.1 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.1 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.1 
 
 
484 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  34.98 
 
 
483 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  31.21 
 
 
462 aa  200  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.81 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.75 
 
 
492 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  33.88 
 
 
502 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.79 
 
 
466 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.81 
 
 
477 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.84 
 
 
517 aa  193  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.24 
 
 
476 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.81 
 
 
497 aa  189  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.69 
 
 
573 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.88 
 
 
470 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1261  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  33.56 
 
 
483 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  32.15 
 
 
471 aa  178  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4055  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.6 
 
 
554 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.505018  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.53 
 
 
486 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.78 
 
 
486 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  28.86 
 
 
548 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.79 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.92 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.23 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.43 
 
 
496 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.65 
 
 
552 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.93 
 
 
554 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.35 
 
 
474 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.48 
 
 
474 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  33.04 
 
 
492 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  27.5 
 
 
548 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.99 
 
 
478 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33 
 
 
458 aa  170  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.08 
 
 
549 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1177  hypothetical protein  30.73 
 
 
474 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.7 
 
 
549 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  32.72 
 
 
470 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  31.75 
 
 
470 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36228  predicted protein  29.02 
 
 
453 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.89 
 
 
549 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.62 
 
 
478 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  0.0000101933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.5 
 
 
549 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.18 
 
 
611 aa  169  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  28.22 
 
 
552 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.7 
 
 
560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07761  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.66 
 
 
456 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0845725  normal  0.0349206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  26.13 
 
 
549 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  26.5 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.47 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.98 
 
 
550 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.32 
 
 
547 aa  166  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.94 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0144  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  30.42 
 
 
456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2788  aromatic amino acid decarboxylase  27.06 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2867  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  27.06 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>